Alteración del número de copias de genes reguladores de inflamación como factor predictor de la sobrevida global en pacientes con Hepatocarcinoma e infección viral por VHB/VHC: un estudio bioinformático

Abstract

El hepatocarcinoma (HCC) es el cáncer de hígado más frecuente y agresivo, siendo la tercera causa de mortalidad por cáncer a nivel mundial. El factor etiológico principal es la infección crónica por los virus de la hepatitis B (VHB) y C (VHC), que transforma los hepatocitos y provoca una inflamación crónica. En este contexto, se ha observado que ciertos genes relacionados con la inflamación presentan sobreexpresión, afectando negativamente la sobrevida de los pacientes. Sin embargo, no está claro si la infección por VHB o VHC está relacionada con alteraciones en el número de copias de genes (ANC) que regulan la inflamación, ni cuál es el impacto de dichas alteraciones en la sobrevida global. Para investigar esto, se realizó un análisis de datos genómicos de la cohorte de HCC de The Cancer Genome Atlas (GDC TCGA - LIHC), evaluando las ANC con el recurso web CBioPortal. Los resultados revelaron alteraciones en cuatro genes específicos (CCL24, NAMPT, SLC7A2 y SRI), involucrados en el progreso del HCC. Al analizar la asociación entre las ANC y la sobrevida global mediante el plot de Kaplan-Meier, se observó que los participantes con amplificaciones de genes en la vía de señalización Janus quinasas - Transductor de señales y activador de la transcripción (JAK-STAT) presentaron un peor pronóstico, sugiriendo su implicación en procesos oncogénicos del HCC. Estos hallazgos abren nuevas vías para el desarrollo de biomarcadores pronósticos y potenciales objetivos terapéuticos, que podrían mejorar el tratamiento y la sobrevida de los pacientes. Es fundamental continuar investigando estas ANC y determinar su papel exacto en el HCC.

Hepatocellular carcinoma (HCC) is the most common and aggressive liver cancer, rankingas the third leading cause of cancer-related mortality worldwide. The main etiological factoris chronic infection with hepatitis B (HBV) and C (HCV) viruses, which transform hepatocytes and induce chronic inflammation. In this context, it has been observed that certain inflammation-related genes are overexpressed, negatively affecting patient survival. However, it is unclear whether HBV or HCV infection is associated with alterations in gene copy number (CNA) regulating inflammation or the impact of such alterations on overall survival. To investigate this, a genomic data analysis of the HCC cohort from The Cancer Genome Atlas (GDC TCGA - LIHC) was performed, evaluating CNAs using the CBioPortal web resource. The results revealed alterations in four specific genes (CCL24, NAMPT, SLC7A2, and SRI) involved in the progression of HCC. When analyzing the association between CNAs and overall survival through Kaplan-Meier plots, it was observed that participants with gene amplifications in the Janus kinase - Signal Transducer and Activator of Transcription (JAK-STAT) signaling pathway had a worse prognosis, suggesting their involvement in oncogenic processes in HCC. These findings open new avenues for the development of prognostic biomarkers and potential therapeutic targets that could improve patient treatment and survival. It is crucial to continue investigating these CNAs and determine their exact role in HCC.