Caracterización molecular de la fibra de Adenovirus aviar grupo I aislado de explotaciones avícolas en Perú

Abstract

El objetivo del estudio fue caracterizar molecularmente los serotipos 4, 8b y 11 de Adenovirus aviar grupo I (FAdV-I) aislados de explotaciones avícolas peruanas mediante la Reacción en Cadena de la Polimerasa Múltiple (PCRm) basada en el gen de la fibra adenoviral. Para ello, se diseñaron cebadores a partir de secuencias de oligonucleótidos específicas del gen de la fibra para FAdV-4, 8b y 11. Se caracterizaron 30 aislamientos recolectados entre 1998 al 2021 compatibles a Hepatitis por Cuerpos de Inclusión (HCI) por histopatología. Se optimizó la PCRm a través de distintas condiciones y se desarrollaron controles plasmídicos positivos mediante clonación de los productos amplificados en un sistema bacteriano del tipo Escherichia coli. La PCRm optimizada presentó una sensibilidad de hasta 0.1132 ng/uL y 0.1132 pg/uL usando como templado ADN viral y plasmídico, respectivamente. Del total de 30 muestras evaluadas se identificaron que 14 aislados (46.7%) fueron positivos a FAdV-4, 12 (40%) a FAdV-8b y, dos (6.7%) a FAdV-11. Asimismo, se evidenció coinfección de FAdV-4 y 11 en un aislado (3.3%). Los resultados del PCRm se compararon con el secuenciamiento en base al gen del hexón (prueba de referencia); siendo la sensibilidad de 100% para identificar FAdV-4, 92.3% para FAdV-8b y 100% para FAdV-11. Los hallazgos del presente estudio sostienen que la caracterización molecular de la fibra mediante la PCRm puede constituir una técnica importante y práctica para la detección y diferenciación de los serotipos de FAdV-I.

The objective of the study was to molecularly characterize Fowl adenovirus group I (FAdV-I) serotypes 4, 8b and 11 isolated from Peruvian poultry farms using the Multiple Polymerase Chain Reaction (mPCR) based on the adenoviral fiber gene. For this purpose, primers were designed from specific oligonucleotide sequences of the fiber gene for FAdV-4, 8b and 11. 30 samples collected between 1998 and 2021 compatibles with Inclusion Body Hepatitis (IBH) by histopathology were characterized. The mPCR was optimized through different conditions and the positive control plasmids were developed by cloning of amplified products in a bacterial system of Escherichia coli type. Optimized mPCR presented a sensitivity of up to 0.1132 ng/uL and 1132 pg/uL using viral and plasmid DNA as template, respectively. Of the total of 30 samples evaluated, it was identified that 14 samples (46.7%) were positive for FAdV-4, 12 (40%) for FAdV-8b and, two (6.7%) for FAdV-11. Additionally, FAdV-4 and 11 coinfection was evidenced in one sample (3.3%). mPCR results were compared with hexon gene-based sequencing (gold standard test); being the sensitivity of 100% to identify FAdV-4, 92.3% for FAdV-8b and 100% for FAdV-11. The findings of the present study support that the molecular characterization of the fiber by mPCR could constitute an important and practical technique for the detection and differentiation of FAdV-I serotypes.