Evaluación de métodos fenotípicos para la detección de carbapenemasas OXA-48-like en Enterobacterales

Abstract

Antecedentes: Las carbapenemasas OXA-48-like muestran una rápida expansión a nivel global, y el Perú no es ajeno a ello. La prueba gold estándar para su detección es la PCR y secuenciamiento, pero estos no son accesibles para los establecimientos de salud en nuestro medio. Objetivo: Evaluar el desempeño de métodos fenotípicos para la detección de carbapenemasas OXA-48-like en Enterobacterales, en términos de sensibilidad y especificidad. Material y métodos: Se evaluaron 6 métodos fenotípicos para detectar la presencia de carbapenemasas en general y otros 7, para la detección específica de carbapemasas OXA-48-like. Finalmente se evaluó la concentración mínima inhibitoria (MIC). Resultados: Las pruebas para detección general de carbapenemasas mostraron un buen desempeño analítico con sensibilidades y especificidades superiores a 94%. El CIM y el rCDM mostraron la mejor sensibilidad y especificidad del 99.2% y 100% (coef.Kappa = 0.98). Por otro lado, en la detección específica de OXA-48-like, la mayoría de las pruebas obtuvo una especificidad de 100% a excepción de TZP/ETP y TEM/AVI. El disco de temocilina en agar MH mostró la mayor sensibilidad con un 94% (coef.Kappa = 0.87) y el de menor sensibilidad fue el Disco OXA-48 con un 47% (coef.Kappa = 0.31). Con respecto a la MIC de meropenem, ertapenem e imipenem, se evidenció una diferencia significativa de las medianas (p < 0.001) entre las OXA-48-like y las cepas no productoras de este mecanismo de resistencia. Conclusiones: Las metodologías para detectar carbapenemasas en general mostraron alta sensibilidad y especificidad frente a OXA-48-like, mientras que las pruebas para detección específica de OXA-48-like obtuvieron resultados heterogéneos. Respecto a la MIC, el ertapenem destacó como indicador altamente sensible para este mecanismo de resistencia.

Background: OXA-48-like carbapenemases are rapidly expanding globally, and Peru is no exception. The gold standard test for their detection is the PCR and sequencing, but these are not accessible to health facilities in our area. Objective: To evaluate the performance of phenotypic methods for the detection of OXA-48-like carbapenemases in Enterobacterales, in terms of sensitivity and specificity. Methods and Materials: Six phenotypic methods were evaluated to detect the presence of carbapenemases in general and another 7 for the specific detection of OXA-48-like carbapenemases. Finally, the minimum inhibitory concentration (MIC) was evaluated. Results: Of the 159 isolates evaluated, 117 were OXA-48-like producers. 69.2% of these were Escherichia coli and 4 isolates were dual carbapenemase producers. Within the general carbapenemase detection tests, the CIM and the rCDM showed the best sensitivity and specificity of 99.2% and 100% (Kappa coefficient = 0.98). On the other hand, in the specific detection of OXA-48-like, the temocillin disk on MH agar showed the highest sensitivity with 94% (Kappa coefficient = 0.87). Regarding the MIC of meropenem, ertapenem and imipenem, a significant difference in medians (p < 0.001) was evident between OXA-48-like and strains that do not produce this resistance mechanism. Conclusion: Methodologies for detecting carbapenemases in general showed high sensitivity and specificity against OXA-48-like, while tests for specific detection of OXA-48-like obtained heterogeneous results. Regarding MIC, ertapenem stood out as a highly sensitive indicator for this resistance mechanism.