Comparación de la resistencia antibiótica de Escherichia coli aislada en urocultivos antes y después de la pandemia COVID-19 en una población atendida en el Hospital Cayetano Heredia entre los años 2019 y 2022

Abstract

Antecedentes: El uso de antibióticos para el tratamiento de coinfecciones bacterianas en pacientes con COVID-19 podría suponer una variación significativa en la resistencia antibiótica de diferentes patógenos, incluyendo E. coli. Objetivo: Comparar la resistencia antibiótica de E. coli en urocultivos de pacientes del Hospital Cayetano Heredia antes y después de la pandemia COVID-19, entre los años 2019 y 2022. Materiales y Métodos: Se incluyó registros de urocultivos positivos a E. coli provenientes de pacientes adultos y pediátricos de todos los servicios. Se analizó el perfil de susceptibilidad de E. coli para 22 antibióticos en base a las fichas de registro del Laboratorio de Microbiología y la guía del CLSI. Resultados: Se incluyó un total de 5 308 registros (59,4% del 2019 y 40,6% del 2022). En comparación con el 2019, en el 2022 se evidenció aumento estadísticamente significativo de resistencia a cefalosporinas de tercera y cuarta generación; y disminución estadísticamente significativa a aminoglucósidos, fluoroquinolonas y penicilinas/inhibidores de betalactamasas. Específicamente, se observó aumento de la frecuencia de cepas E. coli BLEE (38,3% a 41,4%), incremento estadísticamente significativo de resistencia a ceftriaxona (38,7% a 42,3%) y reducción estadísticamente significativa de resistencia a ciprofloxacino (61,1% a 54,9%) y gentamicina (27,6% a 21,9%). La resistencia a amikacina (1,9%) y nitrofurantoína (3,8%) no cambió y continúa baja. Conclusiones: Entre el periodo pre y post pandemia hubo aumento significativo de resistencia a cefalosporinas de tercera y cuarta generación y disminución a otros antibióticos. Se recomienda continuar con la vigilancia cercana de la resistencia en E. coli.

Background: Using antibiotics for the treatment of bacterial coinfections in COVID-19 patients may lead to significant variation in antibiotic resistance among different pathogens, including E. coli. Objective: To compare the antibiotic resistance of E. coli in urine cultures from patients at Cayetano Heredia Hospital before and after the COVID-19 pandemic, between 2019 and 2022. Materials and Methods: Records of E. coli-positive urine cultures from adult and pediatric patients from all services were included. E. coli susceptibility profile to 22 antibiotics was analyzed based on the records from the Microbiology Laboratory and CLSI guidelines. Results: 5308 records were included (59.4% from 2019 and 40.6% from 2022). Compared to 2019, there was a statistically significant increase in resistance to third and fourth generation cephalosporins, while a statistically significant decrease to aminoglycosides, fluoroquinolones and penicillins/beta-lactamase inhibitors. Specifically, a rise in ESBL E. coli strains (38.3% to 41.4%) was observed, as well as a statistically significant increase in resistance to ceftriaxone (38.7% to 42.3%) and a statistically significant decrease in resistance to ciprofloxacin (61.1% to 54.9%) and gentamicin (27.6% to 21.9%). Resistance to amikacin (1.9%) and nitrofurantoin (3.8%) remained unchanged and continued to be low. Conclusions: Between the pre- and post-pandemic periods, there was a significant increase in resistance to third and fourth generation cephalosporins and a decrease to other antibiotics. Ongoing close surveillance of resistance in E. coli is recommended.