Publicación: Descripción de péptidos anticancerígenos provenientes de suero de Crocodylus porosus mediante aproximaciones bioinformáticas
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Resumen
Ciertas moléculas presentes en los tejidos de cocodrilos, asociadas a su potente sistema inmune, muestran actividad antimicrobiana y anticancerígena, incluyendo péptidos bioactivos con potencial terapéutico. En este contexto, los cocodrilos poseen Péptidos Antimicrobianos (AMPs), algunos con actividad anticancerígena (ACPs), por ejemplo, los péptidos catiónicos KT2 y RT2, derivados de un péptido natural llamado leucrocin. Recientemente, se observó que un extracto de órganos de Crocodylus porosus tenía actividad anticancerígena in vitro, la cual hipotéticamente se vinculó a ciertos ACPs novedosos predichos en el suero de C. Porosus. A pesar de ello, las propiedades fisicoquímicas y biológicas de esos ACPs predichos en tejidos de cocodrilo no fueron estudiadas. En tal sentido, la presente tesis busca caracterizar, de forma teórica, los ACPs derivados de C. porosus, incluyendo sus propiedades fisicoquímicas, estructurales, perfiles de Absorción, Distribución, Metabolismo, Excreción y Toxicidad (ADMET) y posibles dianas biológicas. Para ello se emplearon tanto herramientas bioinformáticas en línea como softwares locales, tomando en cuenta las secuencias peptídicas de suero de C. porosus disponibles en la literatura. Como resultado se encontró que, a pesar de que la muestra provenía de tejidos de cocodrilo, la mayoría de los péptidos fueron de origen bacteriano o microbiano, destacando cinco péptidos (HFSLLMGSLFK, FMWAAMYSR, DLALHVHK, TYNAKFYK y LVDKLK) por su cationicidad y estructura secundaria de α-hélice, característicos de los ACPs con actividad anticancerígena comprobada. Además, otros seis péptidos con actividad anticancerigena (EPPEPRR, GFWESR, RPSVHK, YQFPPR, FEYGR y SSWKK) mostraron afinidad con dianas involucradas en la regulación de la muerte celular. Se predijo que estos péptidos podrían ejercer un efecto anticancerígeno mediante su interacción con proteínas clave de la vía apoptótica, incluyendo dianas proapoptóticas y antiapoptóticas. Estos péptidos podrían ser investigados en futuros estudios experimentales que validan los hallazgos de esta tesis, encaminados a descubrir ACPs prometedores para el desarrollo de nuevas terapias anticancerígenas.
Resumen
Certain molecules present in crocodile tissues, associated with their potent immune system, exhibit antimicrobial and anticancer activities, including bioactive peptides with therapeutic potential. In this context, crocodiles possess Antimicrobial Peptides (AMPs), some of which also display anticancer activity (ACPs), such as the cationic peptides KT2 and RT2, derived from a natural peptide known as leucrocin. Recently, an extract from Crocodylus porosus organs was observed to exert anticancer activity in vitro, which was hypothetically linked to certain novel ACPs predicted in C. porosus serum. However, the physicochemical and biological properties of these predicted ACPs from crocodile tissues had not been investigated. Therefore, the present thesis aims to theoretically characterize ACPs derived from C. porosus, including their physicochemical and structural properties, Absorption, Distribution, Metabolism, Excretion, and Toxicity (ADMET) profiles, and potential biological targets. To this end, both online bioinformatic tools and local software were employed, using peptide sequences from C. porosus serum reported in the literature. The results revealed that, although the sample originated from crocodile tissues, most of the peptides were of bacterial or microbial origin. Five peptides (HFSLLMGSLFK, FMWAAMYSR, DLALHVHK, TYNAKFYK, and LVDKLK) were notable for their cationicity and α-helical secondary structure, features characteristic of ACPs with proven anticancer activity. In addition, other six anticancer peptides (EPPEPRR, GFWESR, RPSVHK, YQFPPR, FEYGR, and SSWKK) showed affinity for targets involved in the regulation of cell death. It was predicted that these peptides may exert anticancer effects through interactions with key proteins of the apoptotic pathway, including both pro- apoptotic and anti-apoptotic targets. These peptides could be evaluated in future experimental studies to validate the findings of this thesis, with the goal of identifying promising ACPs for the development of novel anticancer therapies.