Primer informe de aislados de enterobacterales productores de OXA-181 en América Latina

Abstract

Antecedentes: Las infecciones por Enterobacterales productoras de carbapenemasas (CPE) son una amenaza creciente para la salud publica. Aunque las enzimas carbapenemasas KPC, NDM e IMP son las más frecuentes en todo el mundo, las β-lactamasas tipo OXA-48 (oxacilinasas) están en aumento. Las enzimas blaOXA-181 (una variante de OXA-48) muestran un alto nivel de actividad hidrolítica contra las penicilinas y un bajo nivel de hidrólisis de los carbapenémicos, con una fuerte preferencia por el imipenem, lo cual es un desafío para el diagnóstico de laboratorio. Objetivo: Caracterizar fenotípicamente y genotípicamente cinco aislamientos clínicos de CPE de dos establecimientos de salud en Lima, Perú. Métodos y Materiales: Estudio transversal, las pruebas de identificación y susceptibilidad se realizaron en el equipo Vitek2(bioMérieux, Francia) y el secuenciamiento de genoma completo se realizó mediante el instrumento Illumina MiSeq(Illumina, EE. UU.). Resultados: Los aislamientos fueron identificados como Klebsiella pneumoniae (n=3), Citrobacter portucalensis y Escherichia coli, todos presentaron fenotipos multirresistentes(MDR). El análisis bioinformático reveló la presencia del gen blaOXA-181 como la única carbapenemasa en todos los aislamientos. También se encontraron genes asociados con la resistencia a aminoglucósidos, tetraciclinas y trimetoprima. El plásmido IncX3 se identificó en todos los genomas en un transposón Tn6361 truncado flanqueado por secuencias de inserción ΔIS26. El gen qnrS1 se encontró aguas abajo de blaOXA-181, lo que confirió resistencia a las fluoroquinolonas a todos los aislados. Conclusión: Reportamos el primer informe de Enterobacterales productores de MDR y OXA-181 de Latinoamérica, en asociación con el gen qnrS1 en plásmidos de tipo IncX3.

Background: Carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) infections are a growing threat to public health. Although carbapenemase enzymes KPC, NDM and IMP are the most prevalent enzymes worldwide, β-lactamases of the OXA-48 (oxacillinase) type are on the rise. The blaOXA-181 enzymes (a variant of OXA-48) show a high level of hydrolytic activity against penicillins and a low level of hydrolysis of carbapenems, with a strong preference for imipenem, which is a challenge for laboratory diagnosis. Objective: To phenotypically and genotypically characterize five clinical isolates of CPE from two health facilities in Lima, Peru. Methods and Materials: Cross-sectional study, identification and susceptibility tests were performed on the Vitek2 equipment (bioMérieux, France) and whole genome sequencing was performed using the Illumina MiSeq instrument (Illumina, USA). Results: Isolates were identified as Klebsiella pneumoniae (n=3), Citrobacter portucalensis and Escherichia coli, all presenting multidrug resistant (MDR) phenotypes. Bioinformatic analysis revealed the presence of the blaOXA-181 gene as the only carbapenemase in all isolates. Genes associated with resistance to aminoglycosides, tetracyclines and trimethoprim were also found. The IncX3 plasmid was identified in all genomes in a truncated Tn6361 transposon flanked by ΔIS26 insertion sequences. The qnrS1 gene was found downstream of blaOXA-181, which conferred fluoroquinolone resistance to all isolates. Conclusion: We report the first report of MDR OXA-181-producing Enterobacteriaceae from Latin America in association with the qnrS1 gene in IncX3-type plasmids.