Publicación: Caracterización del gen β-tubulina de aislamientos ambientales de Aspergillus fumigatus en la ciudad de Lima en el año 2022-2023
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Antecedentes: La aspergilosis es una de las principales causas de enfermedades fúngicas en humanos, especialmente en individuos inmunocomprometidos. Aspergillus fumigatus es relevante por su alta producción de conidios, que se liberan al ambiente, y es causante de infecciones respiratorias no invasivas. El uso de herramientas moleculares y bioinformáticas permite una mejor identificación y caracterización de su patogenicidad. Objetivo: Caracterización del gen β-tubulina de aislamientos ambientales de A. fumigatus colectados durante los años 2022 y 2023. Materiales y métodos: Se realizó un estudio descriptivo de corte transversal, con 33 aislamientos de A. fumigatus, identificados por características fenotípicas y moleculares. Las secuencias del gen β-tubulina se obtuvieron del Laboratorio de Micología Clínica del Instituto de Medicina Tropical Alexander Von Humboldt. Se utilizaron el BLAST, SEQUENCHER y MEGA para la caracterización del gen β-tubulina. Resultados: Se analizaron 33 secuencias, encontrando 2 clados: el clado I que representa el 84.85% (n=28) de las secuencias distribuidos en 4 subclados y el clado II con un 15.1% (n=5). Al comparar con secuencias de GenBank, se reforzó la presencia de los 2 clados, agrupándolos en subclados Ia (Chile, EE. UU. y México) y Ic (Brasil) del clado I. No se encontró relación entre las variantes y el origen geográfico. Conclusiones: Se encontró que existe variabilidad en los aislamientos, identificándose 2 clados de A.fumigatus distribuidos en los distritos de Lima. Este estudio resalta la necesidad de monitorear aislamientos locales de A. fumigatus para detectar mutaciones asociadas a resistencia antifúngica y comprender su evolución en función de las condiciones geográficas.
Resumen
Background: Aspergillosis is one of the main causes of fungal diseases in humans, especially in immunocompromised individuals. Aspergillus fumigatus is relevant for its high production of conidia, which are released into the environment, and it causes non-invasive respiratory infections. The use of molecular and bioinformatics tools allows a better identification and characterization of its pathogenicity. Objective: Characterization of the β-tubulin gene from environmental isolates of A. fumigatus collected during the years 2022 and 2023. Materials and methods: A descriptive cross-sectional study was carried out with 33 A. fumigatus isolates, identified by phenotypic and molecular characteristics. The β-tubulin gene sequences were obtained from the Clinical Mycology Laboratory of the Alexander Von Humboldt Institute of Tropical Medicine. BLAST, SEQUENCHER and MEGA were used to characterize the β-tubulin gene. Results: 33 sequences were analyzed, finding 2 clades: clade I, which represents 84.85% (n=28) of the sequences distributed in 4 subclades, and clade II with 15.1% (n=5). When comparing with GenBank sequences, the presence of the 2 clades was reinforced, grouping them into subclades Ia (Chile, USA and Mexico) and Ic (Brazil) of clade I. No relationship was found between the variants and the geographic origin. Conclusions: It was found that there is variability in the isolates, identifying 2 clades of A. fumigatus distributed in the districts of Lima. This study highlights the need to monitor local isolates of A. fumigatus to detect mutations associated with antifungal resistance and understand its evolution depending on geographical conditions.