Análisis transcriptómico de la respuesta a heladas en papas nativas

Espinoza Kou, Mey-Ling Rita

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Maestría en Bioquímica y Biología Molecular
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dc.contributor.advisor	Neyra Valdez, Lidio Edgar	es_ES
dc.contributor.author	Espinoza Kou, Mey-Ling Rita	es_ES
dc.date.accessioned	2018-02-05T19:31:42Z
dc.date.available	2018-02-05T19:31:42Z
dc.date.issued	2017
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/20.500.12866/1037
dc.description.abstract	Las heladas constituyen un fenómeno recurrente que afectan la producción y el rendimiento de los cultivos como la papa. En el Perú existen algunas especies de papas nativas tolerantes a heladas que constituyen un importante reservorio genético para el fitomejoramiento de este tubérculo. En esta investigación se caracterizó el transcriptoma de la papa en respuesta a heladas utilizando la técnica RNAseq. Se trabajó con una especie de papa nativa tolerante (Solanum goniocalyx) y una susceptible (S. stenotomum). Se generaron 24 bibliotecas con 31 millones de lecturas por biblioteca. Se observó que aproximadamente 80% de lecturas eran de mapeo único, 9% de mapeo múltiple y 12% no mapean al genoma de referencia. Comparando los niveles de expresión, se notó que la especie tolerante expresaba diferencialmente entre 354 y 629 genes, mientras que la susceptible, entre 1,590 y 3,164. Adicionalmente, se notó que, en la especie tolerante 110 genes son específicamente inducidos durante la respuesta temprana al estrés. Finalmente, se logró correlacionar los perfiles de expresión diferencial entre los genes, obteniéndose 7 módulos (por especie). Esta investigación permitió generar información importante para estudios posteriores en fitomejoramiento de papas de importancia alimenticia y económica que se encuentren perjudicadas por las recurrentes bajas temperaturas.	es_ES
dc.format	application/pdf	es_ES
dc.language.iso	spa	es_ES
dc.publisher	Universidad Peruana Cayetano Heredia	es_ES
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess	es_ES
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es	es_ES
dc.subject	Transcriptoma	es_ES
dc.subject	Perfilación de la Expresión Génica	es_ES
dc.subject	Solanum tuberosum	es_ES
dc.subject	Helada	es_ES
dc.title	Análisis transcriptómico de la respuesta a heladas en papas nativas	es_ES
dc.type	info:eu-repo/semantics/masterThesis	es_ES
thesis.degree.name	Maestro en Bioquímica y Biología Molecular	es_ES
thesis.degree.grantor	Universidad Peruana Cayetano Heredia. Escuela de Posgrado Víctor Alzamora Castro	es_ES
thesis.degree.discipline	Bioquímica y Biología Molecular	es_ES
dc.publisher.country	PE	es_ES
dc.subject.ocde	https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.03	es_ES
renati.type	http://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis	es_ES
renati.level	http://purl.org/pe-repo/renati/level#maestro	es_ES
renati.discipline	917067	es_ES