En la alpaca adulta y en fetos de tercer tercio de gestación, el cuerno uterino izquierdo es más grande que el derecho, además de que presenta ventaja en cuanto a la irrigación. El presente trabajo buscó identificar el momento de diferenciación del tamaño de los cuernos uterinos y los factores morfológicos que influenciaban esta diferencia, basándose en las relaciones topográficas de éstos con los órganos vecinos, el desarrollo de la vascularización (macroscópico y microscópico) y el estudio microscópico de la estructura de los cuernos uterinos. Con tal fin se trabajaron muestras de embriones y fetos hembras de diferentes tamaños obtenidos en el Camal Municipal de la Ciudad de Huancavelica, Perú. Los resultados del estudio topográfico indicaron la influencia del desarrollo del estómago y el bazo sobre la forma y la posición del útero, así como la influencia de la flexura del colon sigmoideo sobre el cuerno uterino derecho. Macroscópicamente, se observó un patrón vascular similar al de úteros de tercer tercio y de los adultos, encontrando una rama comunicante entre las arterias uterinas. En el estudio microscópico, a pesar de que las medidas de altura del epitelio endometrial y de grosor de la túnica muscular, así como el número y medida de vasos sanguíneos, fueron mayores en el cuerno izquierdo, no se encontró diferencia estadística significativa. Se concluye que la diferenciación del tamaño de los cuernos uterinos es evidente en el inicio del segundo tercio gestacional y esta condición está influenciada por la posición y el tamaño de las vísceras abdominales, lo que permite un mayor desarrollo del cuerno uterino izquierdo.