Universidad Peruana Cayetano Heredia

Frecuencia y patotipos de Escherichia coli diarrogénicas en niños peruanos con y sin diarrea

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dc.contributor.author Ochoa Woodell, Theresa Jean
dc.contributor.author Mercado, E.H.
dc.contributor.author Durand Vara, David Percy
dc.contributor.author Rivera, F.P.
dc.contributor.author Mosquito, S.
dc.contributor.author Contreras, C.
dc.contributor.author Riveros Ramirez, Maribel Denise
dc.contributor.author Lluque, A.
dc.contributor.author Barletta, F.
dc.contributor.author Prada, A.
dc.contributor.author Ruiz, Joaquim
dc.date.accessioned 2022-01-18T19:34:41Z
dc.date.available 2022-01-18T19:34:41Z
dc.date.issued 2011
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/20.500.12866/11132
dc.description.abstract Introduction. Diarrheagenic E. coli (DEC) are a major cause of diarrhea in children in developing countries. However, they are not part of routine diagnosis in clinical laboratories. Objectives. To determine the DEC prevalence in Peruvian children and to describe the genetic variability of these strains. Materials and methods. A total of 8 003 E. coli strains previously isolated from eight different studies of diarrhea in children, mainly from peri-urban areas of Lima, were analyzed. Diagnosis of DEC was done with Multiplex real-time PCR using genes for each of the 6 DEC groups. Conventional PCR was performed for the detection of additional virulence genes. Results. Globally, the mean prevalence in diarrhea samples (n=4,243) was: enteroaggregative E. coli (EAEC) 9.9%, enteropathogenic E. coli (EPEC) 8.5%, enterotoxigenic E. coli (ETEC) 6.9%, diffusely adherent E. coli (DAEC) 4.8%, Shiga toxin-producing E. coli (STEC) 0.8% and enteroinvasive E. coli (EIEC) 0.6%. The relative frequency of each pathogen varies according to the age and the type of study. The main pathotypes in control samples (n=3,760) were EPEC (10.9%) and EAEC (10.4%). An important variability in the virulence genes frequency and molecular resistance mechanisms for each pathotype was found, without differences between diarrhea and control groups. Conclusions. DEC are a major cause of diarrhea in Peruvian children. These pathogens are highly heterogeneous. Additional studies are required to determine the prevalence in rural areas of Peru and in severe diarrhea cases. en_US
dc.description.abstract Introducción. Las E. coli diarrogénicas (DEC) son una de las principales causas de diarrea en niños en países en vías de desarrollo. Sin embargo, no son rutinariamente diagnosticadas en los laboratorios clínicos. Objetivos. Determinar la prevalencia de las DEC en niños peruanos y describir la variabilidad genética de estas cepas. Materiales y métodos. Se utilizaron 8 003 cepas de E. coli previamente aisladas de ocho estudios previos de diarrea en niños, mayormente en zonas periurbanas de Lima. El diagnóstico de las DEC fue a través de un PCR múltiple a tiempo real para los seis grupos de DEC. Se empleó PCR para la determinación de genes adicionales de virulencia. Resultados. La prevalencia promedio global en muestras de diarrea (n=4 243) fue: E. coli enteroagregativa (EAEC) 9,9%, enteropatogénica (EPEC) 8,5%, enterotoxigénica (ETEC) 6,9%, difusamente adherente (DAEC) 4,8%, productora de toxina shiga (STEC) 0,8% y enteroinvasiva (EIEC) 0,6%. La frecuencia relativa de cada patógeno varía según la edad y tipo de estudio. Los principales patotipos en muestras control (n=3 760) fueron EPEC (10,9%) y EAEC (10,4%). Se encontró una gran variabilidad en la frecuencia de genes de virulencia para cada patotipo, así como en los mecanismos moleculares de resistencia, sin diferencias significativas entre muestras de diarrea y control. Conclusiones. Las DEC son causa importante de diarrea en niños peruanos. Estos patógenos son altamente heterogéneos. Se requieren estudios adicionales para determinar la prevalencia en zonas rurales del Perú, así como en casos graves de diarrea. es_PE
dc.language.iso spa
dc.publisher Instituto Nacional de Salud
dc.relation.ispartofseries Revista Peruana de Medicina Experimental y Salud Pública
dc.rights info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es
dc.subject Child en_US
dc.subject Peru en_US
dc.subject controlled study en_US
dc.subject non age distribution en_US
dc.subject prevalence en_US
dc.subject gene frequency en_US
dc.subject Diarrhea en_US
dc.subject Escherichia coli en_US
dc.subject genetic variability en_US
dc.subject diarrheagenic Escherichia coli en_US
dc.subject enterotoxigenic Escherichia coli en_US
dc.subject bacterial strain en_US
dc.subject bacterial virulence en_US
dc.subject enteropathogenic Escherichia coli infection en_US
dc.subject enteroaggregative Escherichia coli en_US
dc.subject Shiga toxin producing Escherichia coli en_US
dc.subject pathotype en_US
dc.subject diffusely adherent Escherichia coli en_US
dc.subject enteroinvasive Escherichia coli en_US
dc.subject molecular mechanics en_US
dc.subject Virulence en_US
dc.title Frecuencia y patotipos de Escherichia coli diarrogénicas en niños peruanos con y sin diarrea es_PE
dc.title.alternative Frequency and pathotypes of diarrheagenic Escherichia coli in peruvian children with and without diarrhea en_US
dc.type info:eu-repo/semantics/article
dc.identifier.doi https://doi.org/10.1590/S1726-46342011000100003
dc.subject.ocde https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.05
dc.relation.issn 1726-4642


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