El virus Papiloma Humano es el agente causal del cáncer de cuello uterino, el cual es la primera causa de muerte en mujeres en el Perú. La implementación de la vacuna tetravalente contra dos genotipos de alto riesgo, HPV 16 y 18, Y dos de bajo riesgo, HPV 11 y 6, es la principal forma de evitar la infección del virus y por ende el desarrollo de lesiones cancerígenas. Es por esto que definir las poblaciones blanco para la vacuna es crucial. Sin embargo, el alto costo de las técnicas de diagnóstico no ha permitido caracterizar la distribución de los genotipos virales asociados a lesiones en el Perú, por lo que el diseño de la vacuna se basa en programas epidemiológicos internacionales. El método gold standard para la detección y genotipificación del virus usa primers consenso para el gen L 1 (primers PGMY09/11) y sondas específicas para cada genotipo. Esta técnica es muy costosa y las sondas utilizadas no incluyen a los genotipos encontrados en regiones de América Latina. Este trabajo usó primers genotipo-específicos para detectar y genotipificar en un solo paso los cuatro tipos de HPV de la vacuna tetravalente y demostró que la prevalencia de estos tiene un patrón diferente al reportado a nivel internacional, y que esta técnica es válida y costo efectiva para evaluar las prevalencias de otros genotipos en el futuro.