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Estandarización de la técnica de Amplificación Isotérmica Mediada por Bucles (LAMP) dúplex para la detección simultánea de Aeromonas salmonicida y Yersinia ruckeri en cepas aisladas de Oncorynchus mykiss “Trucha arcoíris”

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dc.contributor.advisor Serrano Martínez, Marcos Enrique es_ES
dc.contributor.advisor Burga Cisterna, César Abel es_ES
dc.contributor.author Yupanqui Arias, María Yeny es_ES
dc.date.accessioned 2022-02-09T21:23:55Z
dc.date.available 2022-02-09T21:23:55Z
dc.date.issued 2022
dc.identifier.other 201759 es_ES
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/20.500.12866/11356
dc.description.abstract Aeromonas salmonicida y Yersinia ruckeri son bacterias patógenas de Trucha arcoíris; su detección temprana mediante el uso de pruebas de diagnóstico es fundamental para evitar la propagación bacteriana y la mortalidad excesiva en los sistemas de producción. Sin embargo, el uso de pruebas de diagnóstico no se realiza debido a que son costosas, requieren de laboratorios sofisticados y se realizan en ciudades alejadas de los centros de producción. Por ello, este trabajo tuvo como objetivo estandarizar la técnica de Amplificación Isotérmica Mediada por Bucle (LAMP), una prueba de diagnóstico molecular rápido altamente sensible y de bajo costo, para detectar simultáneamente A. salmonicida y Y. ruckeri en cepas aisladas de Trucha arcoíris. Se diseñó primers LAMP para la detección de A. salmonicida y Y. ruckeri mediante los genes vapA y rucC-rupB, respectivamente. Se elaboró un protocolo LAMP DÚPLEX corrido a 60°C durante 60 min y detenido a 80°C por 10 min. Los primers fueron específicos para A. salmonicida y Y. ruckeri, no observándose reacciones cruzadas con Aeromonas hydrophila, Virus de la Necrosis Pancreática Infecciosa, Flavobacterium psychrophilum, Renibacterium salmoninarum, especies relacionadas con enfermedades infecciosas de Trucha arcoíris. Además, de Staphylococcus aureus, Echerenchia coli, Pseudomonas aeruginosa y Yersinia enterocolítica, especies bacterianas relacionadas con la contaminación ambiental y de manipulación. Finalmente, la sensibilidad analítica de LAMP fue superior a la técnica gold estándar PCR. es_ES
dc.description.abstract Aeromonas salmonicida and Yersinia ruckeri are pathogenic bacteria of rainbow trout; Its early detection through the use of diagnostic tests is essential to avoid bacterial spread and excessive mortality in production systems. However, the use of diagnostic tests are not implements because they are expensive, require sophisticated laboratories and are carried out in cities far from production centers. Therefore, this work aimed to standardize the Loop Mediated Isothermal Amplification (LAMP) technique, a highly sensitive and inexpensive rapid molecular diagnostic test, to simultaneously detect A. salmonicida and Y. ruckeri in isolated strains of rainbow trout. LAMP primers were designed for the detection of A. salmonicida and Y. ruckeri through the vapA and rucC-rupB genes, respectively. A LAMP DUPLEX protocol was developed, running at 60°C for 60 min and stopped at 80°C for 10 min. The primers were specific for A. salmonicida and Y. ruckeri, not observing cross-reactions with Aeromonas hydrophila, Infectious Pancreatic Necrosis Virus, Flavobacterium psychrophilum, Renibacterium salmoninarum, species related to infectious diseases of rainbow trout. In addition, Staphylococcus aureus, Echerenchia coli, Pseudomonas aeruginosa and Yersinia enterocolitica, bacterial species related to environmental contamination and handling. Finally, the analytical sensitivity of LAMP was superior to the gold standard PCR technique. es_ES
dc.format application/pdf es_ES
dc.language.iso spa es_ES
dc.publisher Universidad Peruana Cayetano Heredia es_ES
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess es_ES
dc.rights.uri https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es es_ES
dc.subject Amplificación Isotérmica es_ES
dc.subject Detección es_ES
dc.subject Yersinia ruckeri es_ES
dc.subject Aeromonas salmonicida es_ES
dc.subject Onchorynchus mykiss es_ES
dc.title Estandarización de la técnica de Amplificación Isotérmica Mediada por Bucles (LAMP) dúplex para la detección simultánea de Aeromonas salmonicida y Yersinia ruckeri en cepas aisladas de Oncorynchus mykiss “Trucha arcoíris” es_ES
dc.type info:eu-repo/semantics/masterThesis es_ES
thesis.degree.name Maestro en Sanidad Acuícola es_ES
thesis.degree.grantor Universidad Peruana Cayetano Heredia. Escuela de Posgrado Víctor Alzamora Castro es_ES
thesis.degree.discipline Sanidad Acuícola es_ES
dc.publisher.country PE es_ES
dc.subject.ocde http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.01 es_ES
dc.subject.ocde http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.12 es_ES
renati.author.dni 46535289
renati.advisor.orcid https://orcid.org/0000-0002-4452-2666 es_ES
renati.advisor.orcid https://orcid.org/0000-0002-2373-845X es_ES
renati.advisor.dni 09822964
renati.advisor.dni 44273999
renati.type http://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis es_ES
renati.level http://purl.org/pe-repo/renati/nivel#maestro es_ES
renati.discipline 831197 es_ES
renati.juror Shiva Ramayoni, Carlos Martín es_ES
renati.juror Rodríguez Bailón, Jorge Enrique es_ES
renati.juror Llerena Zavala, Cielo Aydelí es_ES


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info:eu-repo/semantics/openAccess Except where otherwise noted, this item's license is described as info:eu-repo/semantics/openAccess

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