Estandarización de la técnica de Amplificación Isotérmica Mediada por Bucles (LAMP) dúplex para la detección simultánea de Aeromonas salmonicida y Yersinia ruckeri en cepas aisladas de Oncorynchus mykiss “Trucha arcoíris”

Yupanqui Arias, María Yeny

dc.contributor.advisor	Serrano Martínez, Marcos Enrique	es_ES
dc.contributor.advisor	Burga Cisterna, César Abel	es_ES
dc.contributor.author	Yupanqui Arias, María Yeny	es_ES
dc.date.accessioned	2022-02-09T21:23:55Z
dc.date.available	2022-02-09T21:23:55Z
dc.date.issued	2022
dc.identifier.other	201759	es_ES
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/20.500.12866/11356
dc.description.abstract	Aeromonas salmonicida y Yersinia ruckeri son bacterias patógenas de Trucha arcoíris; su detección temprana mediante el uso de pruebas de diagnóstico es fundamental para evitar la propagación bacteriana y la mortalidad excesiva en los sistemas de producción. Sin embargo, el uso de pruebas de diagnóstico no se realiza debido a que son costosas, requieren de laboratorios sofisticados y se realizan en ciudades alejadas de los centros de producción. Por ello, este trabajo tuvo como objetivo estandarizar la técnica de Amplificación Isotérmica Mediada por Bucle (LAMP), una prueba de diagnóstico molecular rápido altamente sensible y de bajo costo, para detectar simultáneamente A. salmonicida y Y. ruckeri en cepas aisladas de Trucha arcoíris. Se diseñó primers LAMP para la detección de A. salmonicida y Y. ruckeri mediante los genes vapA y rucC-rupB, respectivamente. Se elaboró un protocolo LAMP DÚPLEX corrido a 60°C durante 60 min y detenido a 80°C por 10 min. Los primers fueron específicos para A. salmonicida y Y. ruckeri, no observándose reacciones cruzadas con Aeromonas hydrophila, Virus de la Necrosis Pancreática Infecciosa, Flavobacterium psychrophilum, Renibacterium salmoninarum, especies relacionadas con enfermedades infecciosas de Trucha arcoíris. Además, de Staphylococcus aureus, Echerenchia coli, Pseudomonas aeruginosa y Yersinia enterocolítica, especies bacterianas relacionadas con la contaminación ambiental y de manipulación. Finalmente, la sensibilidad analítica de LAMP fue superior a la técnica gold estándar PCR.	es_ES
dc.description.abstract	Aeromonas salmonicida and Yersinia ruckeri are pathogenic bacteria of rainbow trout; Its early detection through the use of diagnostic tests is essential to avoid bacterial spread and excessive mortality in production systems. However, the use of diagnostic tests are not implements because they are expensive, require sophisticated laboratories and are carried out in cities far from production centers. Therefore, this work aimed to standardize the Loop Mediated Isothermal Amplification (LAMP) technique, a highly sensitive and inexpensive rapid molecular diagnostic test, to simultaneously detect A. salmonicida and Y. ruckeri in isolated strains of rainbow trout. LAMP primers were designed for the detection of A. salmonicida and Y. ruckeri through the vapA and rucC-rupB genes, respectively. A LAMP DUPLEX protocol was developed, running at 60°C for 60 min and stopped at 80°C for 10 min. The primers were specific for A. salmonicida and Y. ruckeri, not observing cross-reactions with Aeromonas hydrophila, Infectious Pancreatic Necrosis Virus, Flavobacterium psychrophilum, Renibacterium salmoninarum, species related to infectious diseases of rainbow trout. In addition, Staphylococcus aureus, Echerenchia coli, Pseudomonas aeruginosa and Yersinia enterocolitica, bacterial species related to environmental contamination and handling. Finally, the analytical sensitivity of LAMP was superior to the gold standard PCR technique.	es_ES
dc.format	application/pdf	es_ES
dc.language.iso	spa	es_ES
dc.publisher	Universidad Peruana Cayetano Heredia	es_ES
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess	es_ES
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es	es_ES
dc.subject	Amplificación Isotérmica	es_ES
dc.subject	Detección	es_ES
dc.subject	Yersinia ruckeri	es_ES
dc.subject	Aeromonas salmonicida	es_ES
dc.subject	Onchorynchus mykiss	es_ES
dc.title	Estandarización de la técnica de Amplificación Isotérmica Mediada por Bucles (LAMP) dúplex para la detección simultánea de Aeromonas salmonicida y Yersinia ruckeri en cepas aisladas de Oncorynchus mykiss “Trucha arcoíris”	es_ES
dc.type	info:eu-repo/semantics/masterThesis	es_ES
thesis.degree.name	Maestro en Sanidad Acuícola	es_ES
thesis.degree.grantor	Universidad Peruana Cayetano Heredia. Escuela de Posgrado Víctor Alzamora Castro	es_ES
thesis.degree.discipline	Sanidad Acuícola	es_ES
dc.publisher.country	PE	es_ES
dc.subject.ocde	http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.01	es_ES
dc.subject.ocde	http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.12	es_ES
renati.author.dni	46535289
renati.advisor.orcid	https://orcid.org/0000-0002-4452-2666	es_ES
renati.advisor.orcid	https://orcid.org/0000-0002-2373-845X	es_ES
renati.advisor.dni	09822964
renati.advisor.dni	44273999
renati.type	http://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis	es_ES
renati.level	http://purl.org/pe-repo/renati/nivel#maestro	es_ES
renati.discipline	831197	es_ES
renati.juror	Shiva Ramayoni, Carlos Martín	es_ES
renati.juror	Rodríguez Bailón, Jorge Enrique	es_ES
renati.juror	Llerena Zavala, Cielo Aydelí	es_ES