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Caracterización de la variabilidad genética en regiones anónimas y codantes en alpacas (Vicugna pacos) peruanas mediante el análisis de ADN mitocondrial y ADN nuclear

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dc.contributor.advisor Espinoza Babilón, José Ronald es_ES
dc.contributor.author Rodríguez Bailón, Jorge Enrique es_ES
dc.date.accessioned 2018-02-07T06:02:23Z
dc.date.available 2018-02-07T06:02:23Z
dc.date.issued 2014
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/20.500.12866/1141
dc.description.abstract El objetivo del presente estudio fue determinar los niveles de diversidad genética y estructura poblacional en regiones anónimas y genes codantes en alpacas peruanas utilizando marcadores microsatélites, la región control, gen Citocromo B del ADN mitocondrial y 3 genes codantes (K33A, KAP1.1, KAP11.1). Seis poblaciones de alpacas (N=446) pertenecientes a los departamentos de Huancavelica, Junín, Apurímac, Arequipa, Cusco y Puno fueron analizadas con 12 microsatélites, la región hipervariable 1 y 2 (514 pb) de la región control y gen Citocromo B para determinar los niveles de variabilidad, diferenciación genética y relaciones entre las poblaciones. Un total de 182 alelos fueron identificados con una media de 15.17 alelos por locus. Los valores promedio de PIC y HE fueron de 0.794 y 0.821. La magnitud relativa de la diferenciación genética entre poblaciones fue evaluada mediante estadística F. Los valores de FIS y FST para todas las poblaciones fueron de 0.011 (RhoIS = 0.005), y 0.024 (RhoST = 0.0171) respectivamente. Los loci LCA37, LCA66 y la población de Puno estuvieron en desequilibrio de Hardy Weinberg debido a déficit de heterocigotos (p<0.01). Treinta y ocho sitios polimórficos distribuidos en 32 haplotipos fueron encontrados en la región control, con una alta frecuencia de haplotipos únicos (34.38%). La diversidad nucleotídica y haplotípica fueron elevadas en todas las poblaciones de alpacas, con valores de 0.01746 and 0.905 respectivamente. El valor de Tajima’s D (0.46704, p > 0.10) y un análisis de distribución de mal pareado (Mismatch distribution) sugieren equilibrio demográfico en todas las poblaciones de alpacas. Dendogramas de Neighbor-joining construidos en base a los valores de DS, DR , análisis de correspondencia factorial (AFC) y análisis de agrupamientos Bayesiano mostraron la presencia de 3 grupos genéticos: i) Andes Centrales (Junín y Huancavelica), ii) Andes del Sur 1 (Cusco y Arequipa) y iii) Andes del Sur 2 (Puno y Apurímac). Las poblaciones de Puno, Cusco, Apurímac y Arequipa mostraron un patrón de ancestría mixto para los grupos genéticos de Andes del Sur 1 y 2 a diferencia de lo observado en poblaciones de Huancavelica y Junín con un patrón de ancestría específico para el grupo genético de Andes Centrales. Median-joining network mostró 2 haplogrupos presentes en la región control del ADN mitocondrial: i) vicuña y ii) guanaco. Los haplotipos guanaco fueron el tipo de haplotipos más frecuente con un 59.38% del total de haplotipos y estuvo presente en más del 75% de las alpacas. Moderada variabilidad genética fue observada en 8 SNPs pertenecientes a genes de K33A, KAP1.1 y KAP11.1 (HE>0.35), sin embargo no se encontró asociación genética significativa entre alelos, genotipos y haplotipos con características Huacaya y Suri. Los resultados sugieren que las poblaciones de alpacas peruanas mantienen una alta diversidad genética en secuencias nucleares anónimas y en la región control del ADN mitocondrial, así como una moderada diversidad genética en genes codantes, y una baja aunque significativa diferenciación genética entre poblaciones. es_ES
dc.format application/pdf es_ES
dc.language.iso spa es_ES
dc.publisher Universidad Peruana Cayetano Heredia es_ES
dc.rights info:eu-repo/semantics/restrictedAccess es_ES
dc.rights.uri https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es es_ES
dc.subject Camélidos del Nuevo Mundo--Genética es_ES
dc.subject Variación Genética es_ES
dc.subject Repeticiones de Microsatélite es_ES
dc.subject ADN es_ES
dc.title Caracterización de la variabilidad genética en regiones anónimas y codantes en alpacas (Vicugna pacos) peruanas mediante el análisis de ADN mitocondrial y ADN nuclear es_ES
dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis es_ES
thesis.degree.name Doctor en Ciencias con mención en Bioquímica y Biología Molecular es_ES
thesis.degree.grantor Universidad Peruana Cayetano Heredia. Escuela de Posgrado Víctor Alzamora Castro es_ES
thesis.degree.discipline Ciencias con mención en Bioquímica y Biología Molecular es_ES
dc.publisher.country PE es_ES
dc.subject.ocde https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.03 es_ES
renati.type http://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis es_ES
renati.level http://purl.org/pe-repo/renati/level#doctor es_ES
renati.discipline 917018 es_ES


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