Norovirus (NoV) es la causa más común de gastroenteritis aguda a nivel mundial. El virus se clasifica en cinco genogrupos, de los cuales GI y GII infectan al hombre. Cada genogrupo esta subdividido en genotipos, siendo el más prevalente GII.4. Debido a la rápida evolución de la variación antigénica de la proteína de cápside, hay una aparición de nuevas cepas GII.4 que se denominan variantes. La diversidad genética es muy poco conocida en países en desarrollo como el nuestro, y su conocimiento es de importancia para la implementación de medidas de control y prevención. El estudio tuvo como objetivo determinar los genotipos del genogrupo II de Norovirus por episodio de diarreas presentes en la población infantil de San Juan de Miraflores, Lima-Perú; y determinar la utilidad de la región Pol del ORFI con las regiones C y D de la cápside para la identificación de variantes de GII.4. Un total de 215 muestras procedentes de episodios de diarrea causados por GII fueron analizadas mediante qRT-PCR. Los genotipos y variantes de GII.4 fueron determinados usando un software automatizado de genotipificación para enterovirus y norovirus, "Noronet". Se identificó un total de 11 genotipos del GII, siendo el más prevalente GII.4 (46.6%) y tres variantes de GII.4. Además, se observó que infecciones repetitivas de diarrea fueron causadas por diferentes genotipos. Por otro lado, un análisis comparativo de 43 secuencias permitió identificar que la región C es la más útil para determinar las variantes de GII.4, y el análisis de la región Pol permitió identificar una cepa recombinante; GII.4P US95-96/GII.4 Osaka 2007, no reportada previamente. Nuestros resultados indican que la identificación de la variabilidad genética de GII y GII.4 podría servir para manejar e implementar medidas de control como el diseño de vacunas contra las cepas circulantes causantes de brotes de gastroenteritis aguda.