DSpace Repository

Análisis de enriquecimiento funcional y de redes de interacción proteína-proteína de genes diferencialmente expresados en accesiones de Solanum goniocalyx resistente y susceptible a Phytophthora infestans

Show simple item record

dc.contributor.advisor Neyra Valdez, Lidio Edgar es_ES
dc.contributor.advisor De la Cruz Lapa, Germán Fernando es_ES
dc.contributor.author Reátegui Miranda, Johana Alejandra es_ES
dc.date.accessioned 2023-02-06T19:52:02Z
dc.date.available 2023-02-06T19:52:02Z
dc.date.issued 2022
dc.identifier.other 207020 es_ES
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/20.500.12866/13089
dc.description.abstract El tizón tardío, causado por el oomyceto patógeno Phytophthora infestans, es la principal enfermedad que afecta al cultivo de la papa. Debido a que es un riesgo para la seguridad alimentaria, se han identificado genes de resistencia a P. infestans en cultivares comerciales de papa para ser empleados en programas de cruza y fitomejoramiento; sin embargo, son pocos los estudios que han evaluado la resistencia a nivel molecular en variedades locales. En el presente trabajo, se utilizaron herramientas bioinformáticas para determinar las funciones biológicas, rutas metabólicas y relaciones funcionales existentes entre las proteínas putativas de genes diferencialmente expresados (DEGs) en Solanum goniocalyx por su reacción resistente y susceptible a Phytophthora infestans cepa POX-67 a las 0 y 48 horas post-inoculación (hpi). Los resultados evidencian genes más expresados que codifican a quinasas, proteínas NBS-LRR y proteínas relacionadas a almacenamiento de metabolitos secundarios en el estado basal de la accesión resistente Wira Pasña (CIP 704270) en comparación con la susceptible Sumaq Perqa (CIP 703777), los cuales podrían conferir una ventaja constitutiva frente a factores bióticos. No obstante, la resistencia a tizón tardío en Wira Pasña estaría dada por los genes NBS-LRR, encontrando genes anotados como Rpi-vnt1 que se conoce confieren resistencia contra la cepa POX-67. Adicionalmente, se encontraron genes que codifican a proteínas involucradas en mecanismos de retrotransposición, las cuales podrían regular la expresión de los genes de resistencia a P. infestans en Wira Pasña. es_ES
dc.description.abstract Late blight, caused by the pathogen oomycete Phytophthora infestans, is the main disease that affects potato crops. Because of this threat to food security, resistance genes against P. infestans have been identified in commercial potato cultivars to be used in breeding and crop improvement programmes. However, few studies have evaluated molecular resistance in potato landraces. Here, we used bioinformatic tools to determine biological functions, metabolic pathways and functional relationships among putative proteins of differential expressed genes in Solanum goniocalyx by its susceptible and resistant reaction to Phytophthora infestans POX-67 at 0 and 48 hours post inoculation (hpi). The results show more expressed genes that encode kinases, NBS-LRR proteins and proteins related to secondary metabolites storage in the basal state of the resistant accession Wira Pasña (CIP 704270) compared to the susceptible Sumaq Perqa (CIP 703777), which could confer a constitutive advantage against biotic stress. However, the resistance against late blight in Wira Pasña would be given by NBS-LRR genes, being found genes annotated as Rpi-vnt1 known to confer resistance against the POX-67 isolate. In addition, it was found genes that encode proteins involved in retrotransposition mechanisms, which could regulate the expression of resistance genes to P. infestans in Wira Pasña. es_ES
dc.format application/pdf es_ES
dc.language.iso spa es_ES
dc.publisher Universidad Peruana Cayetano Heredia es_ES
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess es_ES
dc.rights.uri https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es es_ES
dc.subject Papa es_ES
dc.subject Solanum goniocalyx es_ES
dc.subject Phytophthora infestans es_ES
dc.subject Tizón Tardío es_ES
dc.subject Genes de Resistencia es_ES
dc.title Análisis de enriquecimiento funcional y de redes de interacción proteína-proteína de genes diferencialmente expresados en accesiones de Solanum goniocalyx resistente y susceptible a Phytophthora infestans es_ES
dc.type info:eu-repo/semantics/bachelorThesis es_ES
thesis.degree.name Licenciado en Biología es_ES
thesis.degree.grantor Universidad Peruana Cayetano Heredia. Facultad de Ciencias y Filosofía Alberto Cazorla Talleri es_ES
thesis.degree.discipline Biología es_ES
dc.publisher.country PE es_ES
dc.subject.ocde http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.02.03 es_ES
dc.subject.ocde http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.10 es_ES
dc.subject.ocde http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.01.06 es_ES
dc.subject.ocde http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.02.02 es_ES
renati.author.dni 73674317
renati.advisor.orcid https://orcid.org/0000-0003-2086-7245 es_ES
renati.advisor.orcid https://orcid.org/0000-0001-7618-799X es_ES
renati.advisor.dni 09608590
renati.advisor.dni 28260181
renati.type http://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis es_ES
renati.level http://purl.org/pe-repo/renati/nivel#tituloProfesional es_ES
renati.discipline 511206 es_ES
renati.juror Clark Leza, Daniel es_ES
renati.juror Gonzáles Lozada, Wilfredo Antonio es_ES
renati.juror De Stefano Beltrán, Luis Julio César es_ES


Files in this item

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

info:eu-repo/semantics/openAccess Except where otherwise noted, this item's license is described as info:eu-repo/semantics/openAccess

Search DSpace


Browse

My Account

Statistics