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Amplificación isotérmica mediada por bucle para la detección colorimétrica de blancos multicopias de Plasmodium vivax y Plasmodium falciparum

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dc.contributor.advisor Gamboa Vilela, Dionicia Baziliza es_ES
dc.contributor.author Nolasco Cardenas, Oscar Patricio es_ES
dc.date.accessioned 2023-04-27T20:40:14Z
dc.date.available 2023-04-27T20:40:14Z
dc.date.issued 2022
dc.identifier.other 201296 es_ES
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/20.500.12866/13456
dc.description.abstract El diagnóstico temprano y especifico es uno de los principales objetivos en las estrategias para el control de la malaria. El presente estudio evalúa la tecnología de amplificación isotérmica mediada por bucle (LAMP del inglés Loop-mediated isothermal amplification), validando un sistema comercial y desarrollando un sistema LAMP colorimétrico “in house” empleando secuencias de genes multicopia para la detección de Plasmodium vivax y de Plasmodium falciparum mediante la visualización directa del cambio de coloración del indicador rojo neutro de amarillo a fucsia en las reacciones positivas. Los límites de detección (LOD del inglés Limit of detection) de las pruebas desarrolladas se estimaron entre 2.4 y 3.7 parásitos/μl de sangre. El mejor desempeño para la detección de P. vivax, fue obtenido con el blanco de amplificación COX1, mientras que el diseño con el blanco de amplificación Pfr364 fue el más específico para la detección de P. falciparum. En el diagnóstico para P. vivax y P. falciparum, los resultados empleando sangre entera indican que el LAMP colorimétrico “in house” puede detectar entre el 36,6 y 80.2 % de infecciones submicroscópicas. La máxima capacidad de detección se logró empleando ADN purificado con filtros de sílice; sin embargo, una preparación rápida de la muestra (Hervido y Centrifugado), mostro resultados tan confiables como los obtenidos por microscopía en muestras de sangre entera o sangre impregnada en papel filtro. es_ES
dc.description.abstract Early and specific diagnosis is one of the main objectives in malaria control strategies. The present study assesses Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) technology, validating a commercial system and developing an in-house colorimetric LAMP system using multicopy gene sequences to detect Plasmodium vivax and Plasmodium falciparum with direct visualization of the color change of the neutral red indicator from yellow to fuchsia in the positives reactions. The limits of detection (LOD) of the test developed were estimated to be between 2.4 and 3.7 parasites/μl of blood. The best performance for the P. vivax detection was obtained with the COX1 amplification target, while the design with the Pfr364 amplification target was the most specific for P. falciparum detection. In the P. vivax and P. falciparum diagnosis, the results using whole blood sample indicate that the colorimetric LAMP in-house can detect between 36.6 and 80.2% of submicroscopic infections. The maximum detection capacity of colorimetric LAMP in-house was achieved using purified DNA with silica filter; however, a rapid sample preparation (Boil & Spin) showed result as reliable as those obtained by microscopy in samples of whole blood or blood impregnated on filter paper. es_ES
dc.format application/pdf es_ES
dc.language.iso spa es_ES
dc.publisher Universidad Peruana Cayetano Heredia es_ES
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess es_ES
dc.rights.uri https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es es_ES
dc.subject Malaria es_ES
dc.subject LAMP es_ES
dc.subject Diagnóstico Molecular es_ES
dc.subject Amplificacion Isotermica es_ES
dc.title Amplificación isotérmica mediada por bucle para la detección colorimétrica de blancos multicopias de Plasmodium vivax y Plasmodium falciparum es_ES
dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis es_ES
thesis.degree.name Doctor en Ciencias de la Vida es_ES
thesis.degree.grantor Universidad Peruana Cayetano Heredia. Escuela de Posgrado Víctor Alzamora Castro es_ES
thesis.degree.discipline Ciencias de la Vida es_ES
dc.publisher.country PE es_ES
dc.subject.ocde http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.01 es_ES
dc.subject.ocde http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.06 es_ES
dc.subject.ocde http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.07 es_ES
dc.subject.ocde http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.08 es_ES
renati.author.dni 15357303
renati.advisor.orcid https://orcid.org/0000-0002-1420-7729 es_ES
renati.advisor.dni 07478767
renati.type http://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis es_ES
renati.level http://purl.org/pe-repo/renati/nivel#doctor es_ES
renati.discipline 511098 es_ES
renati.juror Verástegui Pimentel, Manuela Reneé es_ES
renati.juror Maita Malpartida, Holger es_ES
renati.juror Adaui Sicheri, Vanessa Karina es_ES
renati.juror Pajuelo Travezaño, Mónica Jehnny es_ES


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info:eu-repo/semantics/openAccess Except where otherwise noted, this item's license is described as info:eu-repo/semantics/openAccess

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