Búsqueda de genes relacionados a vías alternas de la resistencia a pirazinamida en cepas clínicas de Mycobacterium tuberculosis mediante transcriptómica (RNAseq)

Campos Tineo, Jen Jhanina

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Maestría en Bioquímica y Biología Molecular
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dc.contributor.advisor	Sheen Cortavarría, Patricia	es_ES
dc.contributor.author	Campos Tineo, Jen Jhanina	es_ES
dc.date.accessioned	2023-09-05T21:12:47Z
dc.date.available	2023-09-05T21:12:47Z
dc.date.issued	2022
dc.identifier.other	206750	es_ES
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/20.500.12866/14037
dc.description.abstract	El aumento de casos de resistencia y el reducido hallazgo de nuevas drogas han limitado el avance en las estrategias de control terapéutico contra tuberculosis (TB). Pirazinamida (PZA), droga de primera línea tiene capacidad de eliminar micobacterias latentes y está incluida en los nuevos regímenes del tratamiento contra TB. A pesar de su importancia, el mecanismo de acción de PZA aún no es claro. Mycobacterium tuberculosis (MTB) resistente a PZA está asociado a mutaciones en el gen pncA que afectan la actividad de PZAsa. Actualmente han sido reportadas cepas resistentes a PZA, pncA wild-type, sugiriéndose la posibilidad de mecanismos de resistencia alterna. Este trabajo tiene como objetivo hallar genes potencialmente involucrados a resistencia alterna a PZA, a través de la evaluación del transcriptoma completo de H37Rv-WT y de 3 aislados clínicos resistentes a PZA, secuenciados mediante NextSeq550, Illumina. Los resultados evidenciaron cambios transcripcionales por PZA en las cepas pncA funcional, sugiriéndose una acción transcripcional mediado por POA. Este trabajo constituye un importante hallazgo en la exploración de genes involucrados en el mecanismo alterno de resistencia a PZA. Entre los principales genes con posible función biológica en resistencia alterna a PZA están genes del metabolismo de lípidos, proteínas reguladoras de metales, reguladores transcripcionales y bombas de eflujo.	es_ES
dc.description.abstract	The increase in cases of resistance and the reduced discovery of new drugs have limited progress in therapeutic control strategies against tuberculosis (TB). The first-line drug PZA has the ability to eliminate latent mycobacteria and is included in new TB treatment regimens. Despite its importance, the mechanism of action of PZA is still unclear. PZA-resistant MTB is associated with mutations in the pncA gene that affect PZAse activity. Currently, strains resistant to PZA, pncA wild-type, have been reported, suggesting the possibility of alternative resistance mechanisms. This work aims to find genes potentially related to alternate resistance to PZA, through the evaluation of the complete transcriptome of MTB-H37RV and 3 strains resistant to PZA, sequenced by NextSeq550, Illumina. The results evidenced transcriptional changes by PZA in the functional pncA strains, suggesting a transcriptional action mediated by POA. This work constitutes an important finding in the exploration of genes involved in the alternative mechanism of resistance to PZA. Among the main genes with a possible relationship to alternative resistance to PZA are lipid metabolism genes, metal regulatory proteins, transcriptional regulators, and efflux pumps.	es_ES
dc.format	application/pdf	es_ES
dc.language.iso	spa	es_ES
dc.publisher	Universidad Peruana Cayetano Heredia	es_ES
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess	es_ES
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es	es_ES
dc.subject	RNA-seq	es_ES
dc.subject	Genes	es_ES
dc.subject	Expresión Diferencial	es_ES
dc.subject	Resistencia	es_ES
dc.subject	Pirazinamida (PZA)	es_ES
dc.subject	Ácido Pirazinoico (POA)	es_ES
dc.subject	Mycobacterium Tuberculosis (MTB)	es_ES
dc.title	Búsqueda de genes relacionados a vías alternas de la resistencia a pirazinamida en cepas clínicas de Mycobacterium tuberculosis mediante transcriptómica (RNAseq)	es_ES
dc.type	info:eu-repo/semantics/masterThesis	es_ES
thesis.degree.name	Maestro en Bioquímica y Biología Molecular	es_ES
thesis.degree.grantor	Universidad Peruana Cayetano Heredia. Escuela de Posgrado Víctor Alzamora Castro	es_ES
thesis.degree.discipline	Bioquímica y Biología Molecular	es_ES
dc.publisher.country	PE	es_ES
dc.subject.ocde	http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07	es_ES
dc.subject.ocde	http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.01.05	es_ES
dc.subject.ocde	http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.02.07	es_ES
dc.subject.ocde	http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.08	es_ES
renati.author.dni	45974600
renati.advisor.orcid	https://orcid.org/0000-0002-7118-9301	es_ES
renati.advisor.dni	09541127
renati.type	http://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis	es_ES
renati.level	http://purl.org/pe-repo/renati/nivel#maestro	es_ES
renati.discipline	206750	es_ES
renati.juror	Rodriguez Bailon, Jorge Enrique	es_ES
renati.juror	Tsukayama Cisneros, Pablo	es_ES
renati.juror	Agapito Panta, Juan Carlos	es_ES