Caracterización de la variabilidad genotípica de cepas patógenas de Yersinia ruckeri aisladas de centros de crianza de trucha arcoíris (Oncorhynchus mykiss) procedentes de la sierra central del Perú mediante la técnica de Tipificación de Secuencias Multilocus (MLST)

Castañeda Castillo, Annie Daniela

dc.contributor.advisor	Serrano Martínez, Marcos Enrique	es_ES
dc.contributor.advisor	Llanco Albornoz, Luis Antonio	es_ES
dc.contributor.author	Castañeda Castillo, Annie Daniela	es_ES
dc.date.accessioned	2023-12-11T14:56:11Z
dc.date.available	2023-12-11T14:56:11Z
dc.date.issued	2023
dc.identifier.other	201839	es_ES
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/20.500.12866/14743
dc.description.abstract	Yersinia ruckeri es reconocido como un patógeno bacteriano que afecta principalmente a la trucha arcoíris (Oncorhynchus mykiss) generando pérdidas económicas en el sector. Es considerado como la especie más genéticamente distante dentro de su género y por poseer variables serotipos, fenotipos, biotipos y diferencias con otros miembros de las Yersiniaceae; además, se evidencia la escases de información sobre las relaciones filogenéticas entre aislados de diferentes regiones del país. El objetivo de este estudio fue caracterizar genotípicamente 15 cepas patógenas de Y. ruckeri, aisladas de truchas arcoíris procedentes de Junín, Lima y Ancash mediante Tipificacion Multilocus de Secuencias (MLST), dichas cepas fueron identificadas por medio de pruebas de biotipaje; se amplificaron, purificaron y secuenciaron seis genes de mantenimiento y se obtuvo el perfil alélico y tipo de secuencias (ST) al comparar los resultados obtenidos con la base de datos del PubMLST para cada cepa. Se identificó 2 STs y el algoritmo BURST confirmó que la población de Y. ruckeri es de tipo clonal. El análisis filogenético determinó relación entre los STs encontrados. Estudios como el presente, permitirá entender la diversidad genética, dinámica poblacional, identificar el probable origen de este patógeno y adoptar mejores medidas en la prevención de epizootias.	es_ES
dc.description.abstract	Yersinia ruckeri is recognized as a bacterial pathogen that mainly affects rainbow trout (Oncorhynchus mykiss), generating economic losses in the sector. It is considered the most genetically distant species within its genus and for having variable serotypes, phenotypes, biotypes, and differences with other members of the Yersiniaceae; In addition, the scarcity of information on the phylogenetic relationships between isolates from different regions of the country is evident. The objective of this study was to genotypically characterize 15 pathogenic strains of Y. ruckeri, isolated from rainbow trout from Junín, Lima and Ancash by Multilocus Sequence Typing (MLST). These strains were identified by means of biotyping tests; six housekeeping genes were amplified, purified, and sequenced, and the allelic profile and type of sequences (ST) were obtained by comparing the results obtained with the PubMLST database for each strain. Two STs were identified and the BURST algorithm confirmed that the Y. ruckeri population is clonal. The phylogenetic analysis determined a relationship between the STs found. Studies such as this one will allow us to understand genetic diversity, population dynamics, identify the probable origin of this pathogen and adopt better measures to prevent epizootics.	es_ES
dc.format	application/pdf	es_ES
dc.language.iso	spa	es_ES
dc.publisher	Universidad Peruana Cayetano Heredia	es_ES
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess	es_ES
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es	es_ES
dc.subject	Acuicultura	es_ES
dc.subject	PubMLST	es_ES
dc.subject	BURST	es_ES
dc.title	Caracterización de la variabilidad genotípica de cepas patógenas de Yersinia ruckeri aisladas de centros de crianza de trucha arcoíris (Oncorhynchus mykiss) procedentes de la sierra central del Perú mediante la técnica de Tipificación de Secuencias Multilocus (MLST)	es_ES
dc.type	info:eu-repo/semantics/masterThesis	es_ES
thesis.degree.name	Maestra en Sanidad Acuícola	es_ES
thesis.degree.grantor	Universidad Peruana Cayetano Heredia. Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia	es_ES
thesis.degree.discipline	Sanidad Acuícola	es_ES
dc.publisher.country	PE	es_ES
dc.subject.ocde	http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.12	es_ES
dc.subject.ocde	http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.03.01	es_ES
renati.author.dni	46847868
renati.advisor.orcid	https://orcid.org/0000-0002-4452-2666	es_ES
renati.advisor.orcid	https://orcid.org/0000-0003-2175-9406	es_ES
renati.advisor.dni	09822964
renati.advisor.dni	10691349
renati.type	http://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis	es_ES
renati.level	http://purl.org/pe-repo/renati/nivel#maestro	es_ES
renati.discipline	831197	es_ES
renati.juror	Shiva Ramayoni, Carlos Martin	es_ES
renati.juror	Yunis Aguinaga, Jefferson	es_ES
renati.juror	Jara Salazar, Luis Miguel	es_ES