Antecedentes: Las infecciones por fungemias son frecuentes y de alta mortalidad. En nuestro país los estudios sobre fungemias son escasos, lo que impide tener un conocimiento actualizado de esta infección. Objetivos: Determinar las características epidemiológicas y clínicas de los pacientes hospitalizados con fungemia, y explorar sus factores asociados en un hospital de tercer nivel de atención entre los años 2013 al 2017. Materiales y método: Estudio descriptivo, tipo serie de casos con exploración de factores asociados que evaluó 115 casos de fungemia nosocomial entre los años 2013 al 2017, utilizando pruebas estadísticas sobre las variables epidemiológicas y clínicas. Se excluyeron los pacientes que no presentaban clínica y las historias clínicas que estuvieron incompletas o reportadas como extraviadas. Resultados y Conclusiones: De los 115 pacientes se excluyeron 25, evaluándose 91 casos en donde se evidenció un ligero predominio del sexo masculino (51%), el rango de edad más frecuentes se encontró entre los 40 y 64 años. El 94% de hongos aislados fueron del género Candida y se describió una mayor frecuencia para Candida no-albicans (54%). UCI-CIQ fue el servicio más frecuente de dónde provino la muestra y dentro de las comorbilidades evaluadas predomina la enfermedad renal (47%). Otras características clínicas frecuentes encontradas fueron el uso de CVC (68%), previo uso de antibioticoterapia de amplio espectro (81%) y pacientes con cirugía previa (52%.) En cuanto a la exploración de asociaciones se evidencio que pacientes ≥ 65 años, neonatos, con enfermedad cardiovascular y con intubación endotraqueal presentaban una asociación con mortalidad. Asimismo aquellos pacientes infectados con el VIH y que adquirieron fungemia en la comunidad están asociados con fungemia por el género no-Candida; mientras que para el género Candida no-albicans se encontró una asociación con cirugía no abdominal y uso previo de antimicóticos.