Universidad Peruana Cayetano Heredia

Evaluación de la diversidad genética de Aeromonas salmonicida patógena aislada de la Sierra peruana mediante MLST

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dc.contributor.advisor Serrano Martínez, Marcos Enrique es_ES
dc.contributor.author Nuñure Ortega, Jeferson es_ES
dc.date.accessioned 2024-02-19T19:05:36Z
dc.date.available 2024-02-19T19:05:36Z
dc.date.issued 2023
dc.identifier.other 104030 es_ES
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/20.500.12866/15011
dc.description.abstract La trucha arcoíris es una importante especie acuícola del Perú que es afectada por Aeromonas sp. Para la identificación de Aeromonas se recomienda un análisis fenotípico, molecular y de filogenia. El MLST (Multilocus Sequence Typing) permite tipificar, establecer asociaciones y relaciones interespecie mediante secuenciación de genes de mantenimiento. El presente estudio descriptivo-interpretativo evaluó la diversidad genética y relacionó 11 cepas patógenas de Aeromonas salmonicida y Aeromonas sp., procedentes de truchas arcoíris afectadas de las regiones de Cajamarca (3), Puno (2), Junín (5) y Ancash (1), usando seis (6) genes housekeeping (recA, gyrB, metG, gltA, groL y ppsA) y datos del Aeromonas MLST Databases. Se identificó las cepas por ARNr 16S, luego se realizó secuenciación, ensamblaje de genomas, detección de genes housekeeping, alineamiento múltiple y relación filogenética por MLST. El análisis MLST halló que las cepas Aeromonas salmonicida 10, 12 (Cajamarca) y 11 (Junín) forman un grupo monofilético muy relacionada a la cepa 6 (Áncash), pero la A. salmonicida cepa 7 (Puno) forma un brazo filogenético diferenciado, mientras las cepas Aeromonas sp. 2, 3, 4, 5 (Junín) y 9 (Puno) forman otro clado superior. La cepa patógena Aeromonas sp. 1 (Cajamarca) forma un clúster diferente mientras la cepa 8 no se relacionó a Aeromonas. Se concluyó que los genes housekeeping analizados son adecuados para reconstruir relaciones de parentesco entre poblaciones de Aeromonas; además, la diversidad genética de las cepas Aeromonas salmonicida y Aeromonas sp. analizadas mostró asociación en dos grandes grupos circulantes, en la sierra norte y sierra centro del Perú, respectivamente. es_ES
dc.description.abstract Rainbow trout is an important aquaculture species in Peru which is affected by Aeromonas sp. For the identification of Aeromonas, a phenotypic, molecular, and phylogeny analysis is recommended. MLST (Multilocus Sequences Typing) allows typifying, establishing associations, and interspecies relationships through housekeeping gene sequencing. This descriptive- interpretative study reclassified and evaluated genetic diversity and related 11 pathogenic strains Aeromonas salmonicida and Aeromonas sp., from diseased rainbow trout from Cajamarca (3), Puno (2), Junín (5), and Ancash (1), using six (6) housekeeping genes (recA, gyrB, metG, gltA, groL, and ppsA) and data from Aeromonas MLST Databases. The strains were identified by means of 16S rRNA, then sequencing, genome assembly, housekeeping gene detection, multiple alignments, and phylogenetic relationship by MLST were performed. The MLST analysis found that Aeromonas salmonicida strains 10, 12 (Cajamarca) and 11 (Junin) form a monophyletic group closely related to strain 6 (Ancash), however, A. salmonicida strain 7 (Puno) forms a differentiated phylogenetic branch, while the Aeromonas sp. 2, 3, 4, 5 (Junin) and 9 (Puno) form another superior clade. The pathogenic strain Aeromonas sp. 1 (Cajamarca) forms a different cluster while strain 8 was not related to Aeromonas. It was concluded that the analyzed housekeeping genes are adequate to reconstruct kinship relationships between populations of Aeromonas; furthermore, the genetic diversity of strains Aeromonas salmonicida and Aeromonas sp. showed association in two large circulating groups, in the northern and central highlands of Peru, respectively. es_ES
dc.format application/pdf es_ES
dc.language.iso spa es_ES
dc.publisher Universidad Peruana Cayetano Heredia es_ES
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess es_ES
dc.rights.uri https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es es_ES
dc.subject MLST es_ES
dc.subject Aeromonas es_ES
dc.subject Truchas es_ES
dc.subject Acuicultura es_ES
dc.subject Perú es_ES
dc.title Evaluación de la diversidad genética de Aeromonas salmonicida patógena aislada de la Sierra peruana mediante MLST es_ES
dc.type info:eu-repo/semantics/masterThesis es_ES
thesis.degree.name Maestro en Sanidad Acuícola es_ES
thesis.degree.grantor Universidad Peruana Cayetano Heredia. Escuela de Posgrado Víctor Alzamora Castro es_ES
thesis.degree.discipline Sanidad Acuícola es_ES
dc.publisher.country PE es_ES
dc.subject.ocde http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.12 es_ES
dc.subject.ocde http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.03.01 es_ES
renati.author.dni 46723476
renati.advisor.orcid https://orcid.org/0000-0002-4452-2666 es_ES
renati.advisor.dni 09822964
renati.type http://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis es_ES
renati.level http://purl.org/pe-repo/renati/nivel#maestro es_ES
renati.discipline 831197 es_ES
renati.juror Shiva Ramayoni, Carlos Martin es_ES
renati.juror Jara Salazar, Luis Miguel es_ES
renati.juror Schiaffino Salazar, Francesca es_ES


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