Vigilancia molecular de los parásitos de la malaria en comunidades remotas de la Amazonia peruana

Cabrera Sosa, Luis Esteban

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Doctorado en Ciencias con mención en Bioquímica y Biología Molecular
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dc.contributor.advisor	Gamboa Vilela, Dionicia Baziliza	es_ES
dc.contributor.advisor	Delgado Ratto, Richard Christopher	es_ES
dc.contributor.author	Cabrera Sosa, Luis Esteban	es_ES
dc.date.accessioned	2024-06-24T21:29:00Z
dc.date.available	2024-06-24T21:29:00Z
dc.date.issued	2024
dc.identifier.other	207543	es_ES
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/20.500.12866/15557
dc.description.abstract	Las comunidades remotas representan el último paso para eliminar malaria en Perú, pero la información sobre la transmisión es escasa. En este trabajo, se investigó la dinámica de transmisión y marcadores de resistencia en Plasmodium vivax (Pv) y P. falciparum (Pf) y deleciones en los genes pfhrp2/3 en Nueva Jerusalén (NJ), una comunidad indígena de Loreto. Para ello, se analizaron muestras de NJ (2019 – 2020, Pv = 68, Pf = 58) mediante los ensayos AmpliSeq. Además, se compararon NJ con otras áreas remotas, y el desempeño del ensayo AmpliSeq con otros métodos como microsatélites y PCR. La población de Pv de NJ mostró una diversidad moderada (He = 0.27) sin diferencias en el tiempo, mientras que la población de Pf mostró una baja diversidad (He = 0.08) y formaron clústeres temporales, uno relacionado con un brote en febrero de 2020. Además, los parásitos Pv de NJ estaban poco y altamente diferenciados de las muestras de Mazán y Yavari, respectivamente (Fst = 0.07 – 0.52). En cambio, Pf en NJ mostró una diferenciación moderada y cierta conectividad con los parásitos de Andoas, Santa Emilia y Mazán (Fst = 0.11 – 0.58). Los parásitos Pf tuvieron mutaciones de resistencia a cloroquina (57%) y sulfadoxina-pirimetamina (35 – 67%), pero ninguna a artemisinina. Además, los genes pfhrp2/3 estaban presentes (50 – 68%) en la mayoría de áreas. Por otro lado, el ensayo AmpliSeq tuvo una mejor resolución que los microsatélites para Pf y similar para Pv, pero no fue concordante con la PCR para la genotipificación de pfhrp2/3. Nuestro estudio muestra una dinámica de transmisión heterogénea y particular de la malaria en NJ y otras áreas alejadas, lo que lleva a proponer estrategias específicas. Los ensayos AmpliSeq representan una herramienta válida para la vigilancia molecular y podría servir para brindar evidencia que contribuya a la toma de decisiones hacia la eliminación de la malaria en Perú.	es_ES
dc.description.abstract	Hard-to-reach communities represent the last challenge for malaria elimination in Peru, but information about transmission is scarce. In this study, we investigated the Plasmodium vivax (Pv) and P. falciparum (Pf) populations in Nueva Jerusalén (NJ), an indigenous community in the Peruvian Amazon, regarding transmission dynamics, resistance markers, and Pf hrp2/3 deletions. We analyzed NJ samples (2019 – 2020, Pv = 68, Pf = 58) using the AmpliSeq assays. Additionally, we compared NJ isolates to other remotes areas, and the assay performance to other methods such as microsatellites and PCR. NJ’s Pv population had modest genetic diversity (He = 0.27) with no differences during the study time, while Pf population displayed low diversity (He = 0.08) and formed temporal clusters, one linked to an outbreak in February 2020. Additionally, NJ's Pv parasites were little and highly differentiated from Mazan and Yavari isolates, respectively (Fst = 0.07 – 0.52). In contrast, Pf in NJ showed modest differentiation and some connectivity with Andoas, Santa Emilia and Mazan parasites (Fst = 0.11 – 0.58). Pf parasites carried resistance mutations to chloroquine (57%) and sulfadoxine-pyrimethamine (35 – 67%), but none to artemisinin. Moreover, pfhrp2/3 genes were present (50 – 68%) in most places. On the other hand, the AmpliSeq assay had better genetic resolution than microsatellites for Pf and similar for Pv but was not concordant with PCR for pfhrp2/3 genotyping. Our study shows a heterogeneous and specific transmission dynamics of malaria in NJ and other remote areas, leading to proposing specific strategies. The AmpliSeq assays represent a valid tool for molecular surveillance and could contribute to malaria elimination in Peru.	es_ES
dc.format	application/pdf	es_ES
dc.language.iso	spa	es_ES
dc.publisher	Universidad Peruana Cayetano Heredia	es_ES
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess	es_ES
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/	es_ES
dc.subject	Población Indígena	es_ES
dc.subject	Ensayo AmpliSeq	es_ES
dc.subject	Dinámica de Transmisión	es_ES
dc.subject	Resistencia Antimaláricos	es_ES
dc.subject	Deleción pfhrp2/3	es_ES
dc.title	Vigilancia molecular de los parásitos de la malaria en comunidades remotas de la Amazonia peruana	es_ES
dc.type	info:eu-repo/semantics/doctoralThesis	es_ES
thesis.degree.name	Doctor en Ciencias con mención en Bioquímica y Biología Molecular	es_ES
thesis.degree.grantor	Universidad Peruana Cayetano Heredia. Escuela de Posgrado Víctor Alzamora Castro	es_ES
thesis.degree.discipline	Ciencias con mención en Bioquímica y Biología Molecular	es_ES
dc.publisher.country	PE	es_ES
dc.subject.ocde	https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.03	es_ES
dc.subject.ocde	https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.06	es_ES
dc.subject.ocde	https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.07	es_ES
dc.subject.ocde	https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.08	es_ES
renati.author.dni	73089368
renati.advisor.orcid	https://orcid.org/0000-0002-1420-7729	es_ES
renati.advisor.orcid	https://orcid.org/0000-0003-2300-5181	es_ES
renati.advisor.dni	07478767
renati.advisor.dni	41998018
renati.type	https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis	es_ES
renati.level	https://purl.org/pe-repo/renati/level#doctor	es_ES
renati.discipline	917018	es_ES
renati.juror	Rodríguez Bailón, Jorge Enrique	es_ES
renati.juror	Adaui Sicheri, Vanessa Karina	es_ES
renati.juror	Machicado Rivero, Claudia Inés Gloria	es_ES