Las propiedades antimicrobianas en los elementos naturales han atraído la atención de investigadores como complemento al cemento endodóntico (CE). Este trabajo se realizó en cuatro fases. La primera fase identificó la efectividad antibacteriana de la Mentha piperita (menta), de la Minthostachys mollis (muña) y del Própolis (tanto en tintura de propóleo como en propóleo Jalks) en cepas de Enterococcus faecalis (E. faecalis) de American Type Culture Collection (ATCC 2982). La segunda fase determinó la efectividad incorporada al CE, ambas con prueba de sensibilidad antibacteriana en dos medios de cultivo (infusión de cerebro y corazón (BHI), agar de cerebro y corazón (BHA)), luego se aplicó coloración Gram (verificado en microscopio). La prueba Mc Farland homogenizó la cantidad de bacterias en las placas Petri, se evaluaron a las 24 horas los halos con un Vernier. La tercera fase determinó la prueba de viabilidad celular (CC50 – MTT), las células incubadas a una atmósfera al 5% de CO2 con 37°C por 24 horas al 95% de humedad. La muestra se incubó con MTT hasta la formación de cristales (formazán), para luego eliminar el medio con 10 ml de dihidrogenasa. La solución solubilizadora (isopropanol 100 microlitros) hasta la completa solubilización y análisis con Enzyme Linkked Immunosorbent Assay (ELISA) (Thermo Fisher Inc, Waltham, Massachusetts, Estados Unidos). La cuarta fase determinó la biocompatibilidad del CE en un modelo In-Vivo de 12 ratas tipo WISTAR machos con 5 meses de edad (300gr a 400gr). Fueron depilados, desinfectados, anestesiados, con incisión (10mm largo por 2 mm profundidad) para las muestras y se suturó. Luego de 30 días se extrajeron y procesaron las muestras. Los resultados en primera fase identificaron a la menta con la mayor inhibición (5.975mm). En la segunda fase, el CE control presentó la mayor inhibición (18.050 ± 0.451 mm), seguido del CE con menta (16.498 ± 0.460 mm). En la tercera fase el CE presento mayor viabilidad y en la cuarta fase el CE con propóleo presentó la mayor biocompatibilidad (4.00 ± 3.00 células). Con el análisis estadístico de varianza (ANOVA) y la prueba post-hoc de Turkey se puede concluir que el efecto antibacteriano de la muña sola fue superior, y la de menor biocompatibilidad en el CE. El CE con menta fue mejor antibacteriano y obtuvo mayor porcentaje de viabilidad.The antimicrobial properties in natural elements have attracted the attention of researchers as a complement to endodontic cement (EC). This work was carried out in four phases. The first phase identified antibacterial effectiveness of Mentha piperita (mint), of Minthostachys mollis (muña) and Própolis (in propolis tincture and propolis Jalks) in Enterococcus Faecalis (E. Faecalis) strains from the American Type Culture Collection (ATCC 2982). The second phase determined the effectiveness incorporated into the CE, both with antibacterial sensitivity testing in two culture media (brain and heart infusion (BHI), brain and heart agar (BHA)), then Gram staining was applied (verified under a microscope). The Mc Farland test homogenized the amount of bacteria in the Petri plate, the halos were evaluated after 24 hours with a Vernier. The third phase determined the cell viability test (CC50 – MTT), the cells incubated in an atmosphere of 5% CO2 with 37°C for 24 hours at 95% humidity. The sample was incubated with MTT until the formation of crystals (formazan), and then the medium was removed with 10 ml of dihydrogenase. The solubilizing solution (isopropanol 100 microliters) until complete solubilization and analysis with Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) (Thermo Fisher Inc, Waltham, Massachusetts, United States). The fourth phase determined the biocompatibility of the CE in an-In-Vivo model of 12 5-month-old male WISTAR-type rats (300g to 400g). They were depilated, disinfected, anesthetized, incised (10mm long by 2mm deep) for samples and sutured. After 30 days, the samples were extracted and processed. The results in the first phase identified the mint with the greatest inhibition (5.975mm). In the second phase, the control CE presented the greatest inhibition (18,050 ± 0.451 mm), followed by the CE with mint (16,498 ± 0.460 mm). In the third phase the EC presented greater viability and in the fourth phase the EC with propolis presented the greatest biocompatibility (4.00 ± 3.00 cells). With the statistical analysis of variance (ANOVA) and Turkey's post-hoc test it can be concluded that the antibacterial effect of muña alone was superior and its biocompatibility was lower in the CE. The CE with mint was better antibacterial and obtained a higher percentage of viability.