Antecedentes: En el Perú, en base a la guía nacional publicada por el Instituto Nacional de Salud, muchos laboratorios aplican el procedimiento manual no estandarizado basado en microscopía para el examen completo de orina. Dentro del proceso analítico, el desarrollo de la fase microscópica implica una serie de pasos cuyas modificaciones subsecuentemente alteran el resultado final. Objetivo: Identificar los factores críticos que influyen en el análisis del sedimento urinario en el protocolo desarrollado dentro del laboratorio clínico Natura Analítica S.A.C, en la ciudad de Pucallpa, Ucayali. Material y métodos: Estudio cualitativo y descriptivo cuyas variables principales fueron: volumen inicial de la muestra, tiempo de lectura, condiciones de centrifugación, tipo de tubo, número de campos observados y volumen de gota añadida. Las variables secundarias fueron el número de leucocitos y hematíes por volumen de sedimento urinario. Se utilizaron los repositorios del PubMed, Elsevier y Proquest para la búsqueda bibliográfica. Asimismo, el protocolo propuesto fue desarrollado tomando como referencias los datos experimentales de Ko y colaboradores. Paralelamente, se revisaron las guías GP16-A3 del CLSI, GP1-P4 del JCCLS y la guía europea del ECLM. Se utilizó un diagrama de Ishikawa de los posibles factores críticos así como un cuadro resumen de los trabajos seleccionados. Resultados: De acuerdo a la revisión sistemática, se identificó a la condición de centrifugación como el factor crítico más importante.