Micro-epidemiología molecular de las infecciones que contribuyen a mantener la transmisión de Plasmodium vivax en comunidades en vías de eliminación de la malaria en la Región Loreto

Ramirez Saavedra, Roberson

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Doctorado en Ciencias con mención en Bioquímica y Biología Molecular
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dc.contributor.advisor	Torres Fajardo, Katherine	es_ES
dc.contributor.advisor	Gamboa Vilela, Dionicia	es_ES
dc.contributor.advisor	Escalante Manzo, Ananias	es_ES
dc.contributor.author	Ramirez Saavedra, Roberson	es_ES
dc.date.accessioned	2025-01-15T17:14:19Z
dc.date.available	2025-01-15T17:14:19Z
dc.date.issued	2024
dc.identifier.other	207483	es_ES
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/20.500.12866/16534
dc.description.abstract	La transmisión de la malaria sigue siendo un problema de salud pública persistente en la Amazonía peruana, reflejada en la alta morbilidad de casos causados por Plasmodium vivax dentro de un contexto de malaria residual a nivel micro-epidemiológico. Ante esta situación, resulta imperativo emplear herramientas como la genética y la genómica poblacional para comprender mejor los factores que mantienen la transmisión residual de la malaria. El objetivo principal de este estudio fue caracterizar molecularmente la micro-epidemiología de las infecciones por P. vivax que contribuyen a perpetuar la transmisión en comunidades remotas que están en proceso de eliminación de la malaria. En el primer capítulo de esta tesis, los resultados destacan la presencia de un 40% de infecciones submicroscópicas y una alta diversidad genética (He = 0.70 ± 0.10), sin cambios significativos entre los períodos 2013 y 2015-2016 (p-valor > 0.05), así como en otras métricas de diversidad genética. Además, se detectaron parásitos clonales, linajes de diferentes orígenes y flujo genético (Fst > 0.5), evidenciado por la introducción de parásitos genéticamente distintos. Este hallazgo motivó el desarrollo del segundo capítulo, que evaluó a los viajeros infectados y caracterizó los patrones de movilización humana, además de analizar la diversidad genómica poblacional y las relaciones genéticas de los parásitos recolectados en las comunidades de Libertad y Urcomiraño. Se encontró un 21% de infecciones por Plasmodium en los viajeros, de las cuales el 89% eran submicroscópicas. La movilidad humana resultó ser heterogénea, con desplazamientos frecuentes hacia Mazán, Iquitos y varias quebradas. Por último, los parásitos recolectados presentaron baja diversidad genómica, con poblaciones clonales (IBD = 90%), la presencia de flujo genético (Fst = 0.15-0.25) entre Libertad y Urcomiraño, y linajes clonales que se mantuvieron a lo largo del tiempo, en función de la proximidad geográfica y el momento de la recolección. En conclusión, tanto las infecciones submicroscópicas como la movilización humana parecen desempeñar un papel clave en el mantenimiento de la transmisión de la malaria residual, revelando nuevos aspectos, a nivel de la genética de los parásitos, que contribuyen con la micro-epidemiología de la malaria en las comunidades estudiadas.	es_ES
dc.description.abstract	Malaria transmission is a persistent public health problem in the Peruvian Amazon. This persistence is reflected in the increased morbidity of cases caused by P. vivax in a micro-epidemiological context of residual malaria within the Peruvian Amazon. For this reason, there is an urgent need to use tools such as population genetics and genomics to help explain the maintenance of residual malaria transmission at the micro- epidemiological level. The overall objective of this study was to molecularly characterize the micro-epidemiology of P. vivax infections that contribute to the maintenance of transmission in remote communities undergoing malaria elimination. The results in Chapter 1 of this thesis highlight the presence of 40% submicroscopic infections, with high genetic diversity (He=0.70 ± 0.10) with no significant changes (p-value>0.05) between 2013 and 2015-2016 and the other metrics of genetic diversity. Clonal parasites and lineages with different origins were also found, plus the presence of gene flow (Fst>0.5) evidenced by the entry of new genetically unrelated parasites. Due to this last finding, Chapter 2 of this thesis was developed, where the infected travelers were evaluated and the mobilization and human mobilization were characterized, and the population genomic diversity and genetic relationships of the parasites collected in Libertad and Urcomiraño were also evaluated. We found 21.0% of Plasmodium spp. infections in travelers, 89% of these infections were submicroscopic. Human mobilization was heterogeneous with frequent trips to Mazan, Iquitos and creeks. Finally, the parasites collected showed low genomic diversity, with clonal populations (IBD=90%), presence of gene flow (Fst=0.15-0.25) between Libertad and Urcomiraño, plus clonal lineages that have been maintained according to the time of collection and the geographic proximity to the collection site. In conclusion, submicroscopic infections as well as human mobilization are having a role in maintaining residual malaria transmission, at level of parasite genetics, that contributes with the malaria micro-epidemiology in the communities included in this study.	es_ES
dc.format	application/pdf	es_ES
dc.language.iso	spa	es_ES
dc.publisher	Universidad Peruana Cayetano Heredia	es_ES
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess	es_ES
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es	es_ES
dc.subject	P. vivax	es_ES
dc.subject	Diversidad Genética	es_ES
dc.subject	Genómica Poblacional	es_ES
dc.subject	Movilización Humana	es_ES
dc.subject	Identidad por Descendencia (IBD)	es_ES
dc.subject	Cuello de Botella	es_ES
dc.title	Micro-epidemiología molecular de las infecciones que contribuyen a mantener la transmisión de Plasmodium vivax en comunidades en vías de eliminación de la malaria en la Región Loreto	es_ES
dc.type	info:eu-repo/semantics/doctoralThesis	es_ES
thesis.degree.name	Doctor en Ciencias con mención en Bioquímica y Biología Molecular	es_ES
thesis.degree.grantor	Universidad Peruana Cayetano Heredia. Escuela de Posgrado Víctor Alzamora Castro	es_ES
thesis.degree.discipline	Bioquímica y Biología Molecular	es_ES
dc.publisher.country	PE	es_ES
dc.subject.ocde	http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.03	es_ES
renati.author.dni	41490250
renati.advisor.orcid	https://orcid.org/0000-0003-0414-7547	es_ES
renati.advisor.orcid	https://orcid.org/0000-0002-1420-7729	es_ES
renati.advisor.orcid	https://orcid.org/0000-0002-1532-3430	es_ES
renati.advisor.dni	10501386
renati.advisor.dni	07478767
renati.type	https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis	es_ES
renati.level	https://purl.org/pe-repo/renati/level#doctor	es_ES
renati.discipline	917018	es_ES
renati.juror	Rodríguez Bailon, Jorge Enrique	es_ES
renati.juror	Romero Condori, Pedro Eduardo	es_ES
renati.juror	Calderon Sanchez, Maritza Mercedes	es_ES
renati.advisor.pasaporte	561946937