Caracterización genómica de aislados clínicos de Pseudomonas aeruginosa resistentes a carbapenémicos en Latinoamérica, enero 2000 - abril 2024

Valeriano Mejia, Shirlay Katherine; Yarasca Castillo, Angel Junior

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Tecnología Médica en la Especialidad de Laboratorio Clínico y Anatomía Patológica
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dc.contributor.advisor	Cuicapuza Arteaga, Diego Bernhard	es_ES
dc.contributor.author	Valeriano Mejia, Shirlay Katherine	es_ES
dc.contributor.author	Yarasca Castillo, Angel Junior	es_ES
dc.date.accessioned	2025-05-16T15:49:26Z
dc.date.available	2025-05-16T15:49:26Z
dc.date.issued	2025
dc.identifier.other	214526	es_ES
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/20.500.12866/17062
dc.description.abstract	Introducción: Las infecciones por Pseudomonas aeruginosa resistentes a carbapenémicos (PA-RC) representan una amenaza latente, debido a que inactivan los antibióticos de última línea terapéutica como los carbapenémicos. Entre los principales mecanismos de resistencia se encuentran las mutaciones en OprD y los genes de carbapenemasas (blaIMP, blaKPC, etc.), sin embargo, la caracterización y distribución de estas mutaciones y alelos en la región aún no está bien documentada. Objetivo: Caracterizar genómicamente aislados clínicos de P. aeruginosa resistentes a carbapenémicos de secuencias genómicas publicadas en Latinoamérica, entre 2000-2024. Metodología: Se ensamblaron los genomas a partir de archivos SRA sin procesar obtenidos de artículos científicos y se analizaron utilizando archivos fasta descargados de NCBI. Se identificaron serotipos, genes de resistencia antimicrobiana, mutaciones y los secuenciotipos más frecuentes. Resultados: Los mecanismos de resistencia más frecuentes fueron mediado por los genes de carbapenemasas blaVIM-2 y blaKPC-2, los cuales estaban asociados con los secuenciotipos ST111 (42.6%) y ST654 (39%), ambos predominantes en Colombia. En contraste, la mutación OprD-V359L estuvo presente en el 27% de los casos asociados al ST233 en Brasil. Conclusión: En Latinoamérica, aproximadamente el 70% de los casos de resistencia se atribuyen a genes de carbapenemasas, mientras que las mutaciones en OprD explican el porcentaje restante. Sin embargo, la determinación de estas mutaciones está limitada a laboratorios especializados.	es_ES
dc.description.abstract	Introduction: Carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa (PA-RC) infections pose a latent threat due to their ability to inactivate last-line therapeutic antibiotics, such as carbapenems. The primary mechanisms of resistance include mutations in OprD and carbapenemase genes (e.g., blaIMP, blaKPC), but the characterization and distribution of these mutations and alleles in Latin America remain poorly documented. Objective: To genetically characterize clinical isolates of carbapenem-resistant P. aeruginosa from published sequences in Latin America between 2000 and 2024. Methods: Genomes were assembled from raw SRA files obtained from scientific articles and analyzed using fasta files downloaded from NCBI. Serotypes, antimicrobial resistance genes, mutations, and the most frequent sequence types were identified. Results: The most common resistance mechanisms were mediated by carbapenemase genes blaVIM-2 and blaKPC-2, which were associated with sequence types ST111 (42.6%) and ST654 (39%), both predominant in Colombia. In contrast, the OprD-V359L mutation was found in 27% of cases associated with ST233 in Brazil. Conclusion: In Latin America, approximately 70% of resistance cases are attributed to carbapenemase genes, while mutations in OprD account for the remaining cases. However, the determination of these mutations is limited to specialized laboratories.	es_ES
dc.format	application/pdf	es_ES
dc.language.iso	spa	es_ES
dc.publisher	Universidad Peruana Cayetano Heredia	es_ES
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess	es_ES
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es	es_ES
dc.subject	Pseudomonas aeruginosa	es_ES
dc.subject	Resistencia Antimicrobiana	es_ES
dc.subject	Epidemiología Molecular	es_ES
dc.subject	Resistencia a Carbapenémicos	es_ES
dc.title	Caracterización genómica de aislados clínicos de Pseudomonas aeruginosa resistentes a carbapenémicos en Latinoamérica, enero 2000 - abril 2024	es_ES
dc.title.alternative	Genomic characterization of carbapenem-resistant clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa in Latin America, January 2000 - April 2024	es_ES
dc.type	info:eu-repo/semantics/bachelorThesis	es_ES
thesis.degree.name	Licenciado en Tecnología Médica en la Especialidad de Laboratorio Clínico y Anatomía Patológica	es_ES
thesis.degree.grantor	Universidad Peruana Cayetano Heredia. Escuela de Posgrado Víctor Alzamora Castro	es_ES
thesis.degree.discipline	Tecnología Médica en la Especialidad de Laboratorio Clínico y Anatomía Patológica	es_ES
dc.publisher.country	PE	es_ES
dc.subject.ocde	http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.01	es_ES
dc.subject.ocde	http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#2.06.02	es_ES
dc.subject.ocde	http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.01.05	es_ES
dc.subject.ocde	http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.09	es_ES
renati.author.dni	77226674
renati.author.dni	72913955
renati.advisor.orcid	https://orcid.org/0000-0002-5735-4614	es_ES
renati.advisor.dni	75272535
renati.type	https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis	es_ES
renati.level	https://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesional	es_ES
renati.discipline	915126	es_ES
renati.juror	Agapito Panta, Juan Carlos	es_ES
renati.juror	Neyra Valdez, Lidio Edgar	es_ES
renati.juror	Quispe Manco, Maria del Carmen	es_ES