Comparación de 2 tratamientos de descontaminación y 3 kits comerciales de extracción de ADN de muestras de esputo de pacientes con Mycobacterium tuberculosis para aplicaciones futuras en secuenciación

Raez Pereyra, Jimena Belen

dc.contributor.advisor	Sheen Cortavarria, Patricia	es_ES
dc.contributor.author	Raez Pereyra, Jimena Belen	es_ES
dc.date.accessioned	2025-10-13T13:46:17Z
dc.date.available	2025-10-13T13:46:17Z
dc.date.issued	2025
dc.identifier.other	213670	es_ES
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/20.500.12866/17756
dc.description.abstract	La determinación molecular de la resistencia en pacientes con tuberculosis (TB) a partir de muestras clínicas es clave para el control de esta enfermedad. Los métodos usados actualmente se basan en kits comerciales que analizan un número limitado de genes. El secuenciamiento masivo de última generación es una herramienta poderosa para conocer la composición genética de cualquier organismo; sin embargo, los resultados dependen de la cantidad y calidad del ADN. La extracción de ADN de muestras clínicas representa un desafío debido a la baja cantidad de bacterias y alta cantidad de contaminantes. En este estudio se comparó la cantidad y calidad del ADN obtenidas de muestras de esputo empleando dos métodos de descontaminación utilizando NaOH-NALC (13,14) y saponina (15,16) y tres kits comerciales de extracción de ADN: ZymoBIOMICS DNA Miniprep Kit (23), Quick-DNA Fungal/Bacterial Miniprep (24) y Quick-DNA Miniprep Plus Kit (25). Asimismo, la cantidad de ADN, la calidad del ADN, la presencia de contaminantes, la relación entre ADN de MTB y humano fueron evaluados, debido a que estos parámetros son críticos porque afectan a la calidad y rendimiento del secuenciamiento. En resumen, esta investigación optimizó los tratamientos de muestras de esputo y métodos de extracción de ADN para aplicaciones futuras de secuenciación.	es_ES
dc.description.abstract	Molecular determination of resistance in tuberculosis (TB) patients from clinical samples is key to disease control. Currently used methods are based on commercial kits that analyze a limited number of genes. Next-generation massive sequencing is a powerful tool for understanding the genetic makeup of any organism; however, results depend on the quantity and quality of DNA. DNA extraction from clinical samples is challenging due to the low bacterial count and high contaminant content. This study compared the quantity and quality of DNA obtained from sputum samples using two decontamination methods using NaOH-NALC (13,14) and saponin (15,16) and three commercial DNA extraction kits: the ZymoBIOMICS DNA Miniprep Kit (23), the Quick-DNA Fungal/Bacterial Miniprep (24), and the Quick-DNA Miniprep Plus Kit (25). Likewise, DNA quantity, DNA quality, the presence of contaminants, and the ratio of MTB to human DNA were evaluated, as these parameters are critical because they affect sequencing quality and performance. In summary, this research optimized sputum sample treatment and DNA extraction methods for future sequencing applications.	es_ES
dc.format	application/pdf	es_ES
dc.language.iso	spa	es_ES
dc.publisher	Universidad Peruana Cayetano Heredia	es_ES
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess	es_ES
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es	es_ES
dc.subject	Extracción de ADN	es_ES
dc.subject	Tratamiento de esputo	es_ES
dc.subject	Cantidad de ADN	es_ES
dc.subject	Calidad de ADN	es_ES
dc.subject	Mycobacterium tuberculosis	es_ES
dc.title	Comparación de 2 tratamientos de descontaminación y 3 kits comerciales de extracción de ADN de muestras de esputo de pacientes con Mycobacterium tuberculosis para aplicaciones futuras en secuenciación	es_ES
dc.type	info:eu-repo/semantics/bachelorThesis	es_ES
thesis.degree.name	Licenciado en Biología	es_ES
thesis.degree.grantor	Universidad Peruana Cayetano Heredia. Facultad de Ciencias e Ingeniería	es_ES
thesis.degree.discipline	Biología	es_ES
dc.publisher.country	PE	es_ES
dc.subject.ocde	https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.00	es_ES
renati.author.dni	74847823
renati.advisor.orcid	https://orcid.org/0000-0002-7118-9301	es_ES
renati.advisor.dni	09541127
renati.type	https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis	es_ES
renati.level	https://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesional	es_ES
renati.discipline	511206	es_ES
renati.juror	Mendez Aranda, Melissa Marlene	es_ES
renati.juror	Evangelista Falcon, Wilfredo	es_ES
renati.juror	Calderon Sanchez de Jimenez, Maritza Mercedes	es_ES