A pesar de los avances en la reducción de la malaria en Perú, medir la exposición en áreas de baja transmisión es crucial para alcanzar su eliminación. Este estudio se enfocó en dos áreas de transmisión muy baja en Loreto y tuvo como objetivo evaluar la relación entre la exposición a malaria y la proximidad a establecimientos de salud. Se recolectaron datos en 38 comunidades de Indiana y Belén, incluyendo 4000 individuos con hogares georreferenciados y muestras sanguíneas analizadas mediante microscopía, PCR y serología. Se aplicó un modelo de regresión de Poisson multinivel con errores robustos y efectos aleatorios para establecimiento de salud, comunidad y hogar, a fin de estimar razones de prevalencia entre la seropositividad a malaria (reciente e histórica) y las variables de estudio. Asimismo, se utilizó un modelo de regresión lineal segmentada para identificar cambios en las tendencias de seropositividad por grupo etario. La estadística local Getis-Ord Gi* detectó agrupamientos de hogares con tasas altas (puntos calientes) o bajas (puntos fríos) de exposición. La seropositividad fue de 2.5% (IC95%: 2.0% - 3.0%) para P. falciparum y de 7.8% (IC95%: 7.0% - 8.7%) para P. vivax, indicando exposición reciente o histórica. La regresión segmentada mostró reducciones en la exposición a P. vivax en el grupo de 40 - 50 años (β1 = 0.043, p = 0.003) y a P. falciparum en el grupo de 50 - 60 años (β1 = 0.005, p = 0.010). Las personas que residían en el cuartil más alejado de los centros de salud presentaron mayor exposición a P. vivax (RP reciente = 15.29, IC95%: 5.52 - 42.35, p<0.001; RP histórica = 6.95, IC95%: 3.35 - 14.40, p<0.001) en comparación con quienes vivían en el cuartil más cercano. Este estudio evidenció la seropositividad demalaria en dos áreas de transmisión muy baja y confirmó el patrón espacial de puntos calientes a medida que aumenta la distancia de las comunidades.Despite progress in reducing malaria in Peru, measuring exposure in low-transmission areas remains crucial to achieving elimination. This study focused on two very low transmission areas in Loreto and aimed to assess the relationship between malaria exposure and proximity to health facilities. Data were collected in 38 communities of Indiana and Belen, including 4000 individuals with georeferenced households and blood samples analysed by microscopy, PCR, and serology. A multilevel Poisson regression model with robust errors and random effects for health facility, community, and household was applied to estimate prevalence ratios between malaria seropositivity (recent and historical) and study variables. In addition, a segmented linear regression model was used to identify changes in seropositivity trends across age groups, and the local Getis-Ord Gi* statistic detected clusters of households with high (hotspots) or low (coldspots) exposure rates. Seropositivity was 2.5% (95% CI: 2.0 - 3.0) for P. falciparum and 7.8% (95% CI: 7.0 - 8.7) for P. vivax, indicating recent or historical exposure. Segmented regression showed reductions in exposure to P. vivax among individuals aged 40 - 50 years (β = 0.043, p = 0.003) and to P. falciparum among those aged 50 - 60 years (β = 0.005, p = 0.010). Individuals living in the most distant quartile from health facilities had higher exposure to P. vivax (PR recent = 15.29, 95% CI: 5.52 - 42.35, p<0.001; PR historical = 6.95, 95% CI: 3.35 - 14.40, p<0.001) compared with those living in the nearest quartile. This study documented malaria seropositivity in two very low transmission areas and confirmed the spatial pattern of hotspots increasing with greater distance from health facilities.