Universidad Peruana Cayetano Heredia

Caracterización genómica de aislados clínicos de Pseudomonas aeruginosa de tres establecimientos de salud de Lima, 2018-2020

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dc.contributor.advisor Tamariz Ortiz, Jesus Humberto es_ES
dc.contributor.advisor Tsukayama Cisneros, Pablo es_ES
dc.contributor.author Martinez Ventura, Anne Marie es_ES
dc.date.accessioned 2025-11-18T16:19:10Z
dc.date.available 2025-11-18T16:19:10Z
dc.date.issued 2025
dc.identifier.other 214657 es_ES
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/20.500.12866/17901
dc.description.abstract Introducción: Pseudomonas aeruginosa, patógeno oportunista responsable de infecciones crónicas y nosocomiales, caracterizado por presentar clones de alto riesgo asociados a fenotipos de multirresistencia, resistencia extrema y panresistencia, lo que dificulta su tratamiento. Actualmente, no se han documentado reportes de estos clones en el Perú. Objetivo: Caracterizar genómicamente, mediante secuenciación del genoma completo, aislados clínicos multirresistentes de P. aeruginosa provenientes de tres establecimientos de salud de Lima entre 2018 y 2020. Metodología: Se secuenciaron y ensamblaron los genomas de 43 aislados clínicos. Se identificaron secuenciotipos, serotipos, genes de resistencia antimicrobiana, mutaciones cromosómicas y genes de virulencia. Asimismo, se realizó un análisis filogenético para determinar relaciones genéticas entre los aislados. Resultados: Se identificaron dos clados principales. El primero agrupó aislados con ST357 y serotipo O11, portadores de genes de resistencia a β-lactámicos (blaAER, blaIMP-93, blaGES), aminoglucósidos (aph(3’’)-Ib, aph(6)- Id, entre otros), junto con mutaciones en pmrB (V15I) y gyrA (D87H). El segundo clado incluyó aislados con ST179 y serotipo O6, y presentaron genes de resistencia como blaIMP-16 y blaIMP-74), genes aminoglucósido-modificadores (aadA11, aadA2) y alteraciones en la porina OprD. Conclusiones: Este estudio evidencia una alta diversidad de mecanismos de resistencia antimicrobiana, incluyendo genes adquiridos y mutaciones, en clones de alto riesgo como el ST357.Estos hallazgos constituyen una base importante para futuras investigaciones en vigilancia genómica de P. aeruginosa en el país. es_ES
dc.description.abstract Introduction: Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic pathogen responsible for chronic and nosocomial infections, characterized by the presence of high-risk clones associated with multidrug-resistant, extensively drug-resistant, and pandrug-resistant phenotypes, which complicates treatment. To date, no reports of these clones have been documented in Peru. Objective: To perform genomic characterization, through whole-genome sequencing, of multidrug-resistant P. aeruginosa clinical isolates obtained from three healthcare facilities in Lima between 2018 and 2020. Methods: The genomes of 43 clinical isolates were sequenced and assembled. Sequence types, serotypes, antimicrobial resistance genes, chromosomal mutations, and virulence genes were identified. In addition, a phylogenetic analysis was conducted to determine the genetic relationships among the isolates. Results: Two main clades were identified. The first grouped isolates with ST357 and serotype O11, carrying resistance genes to β-lactams (blaAER, blaIMP-93, blaGES) and aminoglycosides (aph(3'')-Ib, aph(6)-Id, among others), along with mutations in pmrB (V15I) and gyrA (D87H). The second clade included isolates with ST179 and serotype O6, which harbored resistance genes such as blaIMP-16 and blaIMP-74, aminoglycoside-modifying genes (aadA11, aadA2), and alterations in the porin OprD. Conclusions: This study reveals a high diversity of antimicrobial resistance mechanisms, including both acquired genes and chromosomal mutations, in high-risk clones such as ST357. These findings provide an important foundation for future research on genomic surveillance of P. aeruginosa in the country. es_ES
dc.format application/pdf es_ES
dc.language.iso spa es_ES
dc.publisher Universidad Peruana Cayetano Heredia es_ES
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess es_ES
dc.rights.uri https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es es_ES
dc.subject Pseudomonas Aeruginosa es_ES
dc.subject Resistencia Antimicrobiana es_ES
dc.subject Multidrogorresistencia es_ES
dc.subject Epidemiología Molecular es_ES
dc.title Caracterización genómica de aislados clínicos de Pseudomonas aeruginosa de tres establecimientos de salud de Lima, 2018-2020 es_ES
dc.title.alternative Genomic characterization of clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa from three medical centers in Lima, 2018-2020 es_ES
dc.type info:eu-repo/semantics/bachelorThesis es_ES
thesis.degree.name Licenciado en Tecnología Médica en la Especialidad de Laboratorio Clínico y Anatomía Patológica es_ES
thesis.degree.grantor Universidad Peruana Cayetano Heredia. Facultad de Medicina Alberto Hurtado. Escuela de Tecnología Médica es_ES
thesis.degree.discipline Tecnología Médica en la Especialidad de Laboratorio Clínico y Anatomía Patológica es_ES
dc.publisher.country PE es_ES
dc.subject.ocde https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.04.03 es_ES
renati.author.dni 74845200
renati.advisor.orcid https://orcid.org/0000-0002-0827-8117 es_ES
renati.advisor.orcid https://orcid.org/0000-0002-1669-2553 es_ES
renati.advisor.dni 10431135
renati.advisor.dni 41729481
renati.type https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis es_ES
renati.level https://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesional es_ES
renati.discipline 915126 es_ES
renati.juror Loyola Sosa, Steev Orlando es_ES
renati.juror Agapito Panta, Juan Carlos es_ES
renati.juror Quispe Manco, Maria del Carmen es_ES


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