Por primera vez en Perú se estudió la composición, distribución, abundancia y grado de calcificación de la comunidad de cocolitofóridos. Este estudio se realizó en una transecta frente a Callao (12°S) desde la costa hasta las 50 mn, entre 2014 y 2015. Se determinó un total de 21 especies con dominancia de Emiliania huxleyi tipo A (76 % hasta 548x103cel/L), seguida por Ophiaster spp. (16%) y Florisphaera profunda (5%). Tres morfotipos de E. huxleyi fueron identificados: i) ligeramente calcificado L (40%), ii) medianamente calcificado M (35%) y iii) sobrecalcificado OC (25%). Los morfotipos e índices de calcificación mostraron diferencias costa-océano. Cocósferas de menor tamaño y un mayor índice RTW (grado de calcificación) caracterizó a las formas OC y M que predominaron en la costa en condiciones de afloramiento costero de Aguas Costeras Frías (ACF) y bajo pH. El patrón inverso se observó en la parte oceánica donde el morfotipo L dominó en condiciones de aguas cálidas ASS, mayor estratificación y pH. Este estudio evidencia la alta sensibilidad del grado de calcificación y distribución de cocolitofóridos a la intensidad del afloramiento costero y la distribución de las masas de agua que modifican factores claves como la temperatura, pH, oxígeno y nutrientes.