Universidad Peruana Cayetano Heredia

Expresión diferencial de genes involucrados en la respuesta al estrés por helada en Solanum tuberosum subsp andigena

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dc.contributor.author Martinez, D.
dc.contributor.author López, D.
dc.contributor.author Neyra Valdez, Lidio Edgar
dc.date.accessioned 2018-12-03T17:02:48Z
dc.date.available 2018-12-03T17:02:48Z
dc.date.issued 2018
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/20.500.12866/4295
dc.description.abstract La helada es el estrés abiótico caracterizado por la disminución de la temperatura del aire por debajo de cero grados centígrados, es uno de los problemas de mayor incidencia e impacto en la agricultura andina. Por otro lado, estudios morfológicos y fisiológicos señalan a las papas nativas como fuentes de tolerancia genética al estrés por helada. Sin embargo, las bases moleculares de los mecanismos de tolerancia en papa, aún son desconocidas. La tecnología del secuenciamiento de ARN (RNA-seq) es una excelente herramienta que permite identificar cambios en los perfiles de expresión génica tras el estrés por helada. En este trabajo, el transcriptoma de una variedad de papa tolerante y otra variedad susceptible a helada fueron secuenciados y comparados después de la exposición al estrés por helada (-8 °C) durante una hora, utilizando la técnica del RNA-seq para identificar diferencias en la expresión de genes entre ambas variedades. Se observó que más de 199 millones de lecturas de RNA-seq fueron alineadas al genoma de referencia (Solanum tuberosum Grupo Phureja), lo que corresponde al 82.1% del total de las lecturas obtenidas tras el secuenciamiento. En cuanto a la modulación en la expresión de genes, la variedad tolerante presentó el mayor número de genes expresados diferencialmente (Differentially Expressed Genes, DEGS) sobreexpresados (262 DEGs) y la variedad susceptible presentó el mayor número de DEGs reprimidos (37 DEGs) tras el estrés por helada. es_PE
dc.language.iso spa
dc.publisher Facultad de Ciencias Biológicas. Universidad Nacional Mayor de San Marcos
dc.relation.ispartofseries Revista Peruana de Biologia
dc.rights info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es
dc.subject secuenciamiento ARN es_PE
dc.subject transcriptómica es_PE
dc.subject papa es_PE
dc.subject helada es_PE
dc.subject expresión es_PE
dc.title Expresión diferencial de genes involucrados en la respuesta al estrés por helada en Solanum tuberosum subsp andigena es_PE
dc.type info:eu-repo/semantics/article
dc.identifier.doi https://doi.org/10.15381/rpb.v25i3.15216
dc.subject.ocde https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.01.01
dc.relation.issn 1727-9933


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