El presente estudio tuvo como objetivo principal relacionar la percepción entre el clima organizacional y el síndrome de burnout en el personal asistencial de un instituto de salud de Lima Metropolitana. Este estudio fue no experimental correlacional; habiéndose utilizado una muestra de 80 trabajadores, utilizando dos instrumentos de medición: Cuestionario de Síndrome de Burnout de Maslach Burnout Inventory (MBI) y el Cuestionario de Clima Organizacional de Litwin y Stringer que incluyen 9 dimensiones. Para el análisis de los datos se utilizó, inicialmente porcentajes, medidas de tendencia central y dispersión; además se empleó tablas y gráficos de doble entrada para relacionar las variables, así como la prueba Chi cuadrado. Se obtuvieron como principales resultados que el 48.7% del personal asistencial presentó un nivel alto del síndrome de burnout, mientras que el 38.8% a un nivel medio, el 62.9% del personal asistencial presento un nivel alto en la dimensión de cansancio emocional, el 63.8% presentó un nivel alto en la dimensión despersonalización y un 68.8% un nivel bajo en la dimensión de realización profesional. El 67.2% del personal asistencial percibe un clima organizacional negativo, mientras que solo el 36.9% lo percibe de manera positiva. Se encontró relación significativa entre el síndrome de burnout y la percepción del clima organizacional del personal asistencial, con p = 0.001.