Análisis de la diversidad genética y estructura genética poblacional de Plasmodium falciparum con deleciones en los genes PFHRP2 y PFHRP3 en tres comunidades de la Amazonía Peruana

Quispe Carbajal, Mariella

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Maestría en Bioquímica y Biología Molecular
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dc.contributor.advisor	Gamboa Vilela, Dionicia Baziliza	es_ES
dc.contributor.advisor	Nolasco Cárdenas, Oscar Patricio	es_ES
dc.contributor.author	Quispe Carbajal, Mariella	es_ES
dc.date.accessioned	2017-05-30T17:49:32Z
dc.date.available	2017-05-30T17:49:32Z
dc.date.issued	2017
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/20.500.12866/689
dc.description.abstract	El presente trabajo de investigación tuvo como objetivo estimar la frecuencia de deleción de los genes pfhrp2, pfhrp3 y flanqueantes de P. falciparum, además de determinar la diversidad genética y estructura poblacional de los parásitos con deleción en pfhrp2/pfhrp3 empleando para el análisis genético los marcadores microsatélites. Este estudio descriptivo recolectó muestras de sangre en papel de pobladores de las comunidades de Cahuide, San José de Lupuna (setiembre 2012 a junio 2014); y de la comunidad de Santa Emilia (marzo a noviembre del 2013). Un total de 227 muestras positivas a P. falciparum fueron evaluadas para la amplificación por PCR convencional del exón-2 de pfhrp2, pfhrp3 y genes flanqueantes. Además, se identificaron y estandarizaron protocolos de PCR para la amplificación de 20 marcadores microsatélites, que fueron evaluados en muestras de P. falciparum. Se encontró que el gen pfhrp2 se encuentra delecionado con una frecuencia del 62%, el gen pfhrp3 está delecionado en un 62.1%; además el 47% de parásitos presenta doble deleción en pfhrp2/pfhrp3. Sobre los genes flanqueantes, existe deleción preferencial de los genes PF3D7_08319000 (31.3%) y PF3D7_1372400 (22.9%). La genotipificación multilocus (MLG) con 5 marcadores microsatélites reveló una baja a moderada diversidad del parásito (H= 0.32-0.41) y un significativo linkage disequilibrium (IAs = 0.158, p<0.01). La diferenciación genética poblacional fue moderada (Fst=0.50, p<0.01), con la presencia de dos grandes clusters poblaciones donde el cluster 1 está formado por el genotipo Pfhrp2- (39/48; Fisher=<0.001) y el cluster 2 por el genotipo Pfhrp2+ (52/64, Fisher=<0.001), encontrándose una asociación significativa entre el genotipo Pfhrp2 y la asignación hacia un cluster determinado. Estos resultados indican que las deleciones en el gen pfhrp2 y sus genes flanqueantes han incrementado y que existen deleciones en los genes flanqueantes a pfhrp3 en los parásitos de la Amazonía Peruana. De manera similar, P. falciparum presenta una estructuración poblacional relacionada a la presencia del genotipo pfhrp2-.	es_ES
dc.format	application/pdf	es_ES
dc.language.iso	spa	es_ES
dc.publisher	Universidad Peruana Cayetano Heredia	es_ES
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess	es_ES
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es	es_ES
dc.subject	Plasmodium falciparum	es_ES
dc.subject	Variación Genética	es_ES
dc.subject	Estructuras Genéticas	es_ES
dc.subject	Repeticiones de Microsatélite	es_ES
dc.subject	Reacción en Cadena de la Polimerasa	es_ES
dc.subject	Epidemiología Descriptiva	es_ES
dc.title	Análisis de la diversidad genética y estructura genética poblacional de Plasmodium falciparum con deleciones en los genes PFHRP2 y PFHRP3 en tres comunidades de la Amazonía Peruana	es_ES
dc.type	info:eu-repo/semantics/masterThesis	es_ES
thesis.degree.name	Maestro en Bioquímica y Biología Molecular	es_ES
thesis.degree.grantor	Universidad Peruana Cayetano Heredia. Escuela de Posgrado Víctor Alzamora Castro	es_ES
thesis.degree.discipline	Bioquímica y Biología Molecular	es_ES
dc.publisher.country	PE	es_ES
dc.subject.ocde	https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.03	es_ES
renati.type	http://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis	es_ES
renati.level	http://purl.org/pe-repo/renati/level#maestro	es_ES
renati.discipline	917067	es_ES