Objetivo: Determinar la prevalencia de anemia y sobrepeso u obesidad en niños de 6 a 59 meses, así como sus factores asociados. Método: Se empleó un diseño descriptivo y transversal utilizando la base de datos de la Encuesta Nacional Demográfica de Salud ENDES 2017. La doble carga de anemia y sobrepeso u obesidad fue analizada a partir del diagnóstico de anemia (Hb < 11 g/dL), sobrepeso (Z score > 2 y ≤ 3 DE) y obesidad (Z score > 3 DE) según criterios de la Organización Mundial de la Salud (OMS); las variables sociodemográficas evaluadas fueron: edad, sexo, orden de nacimiento, área de residencia, quintil de riqueza y educación materna. Resultados: 20,342 niños fueron incluidos en el análisis. La prevalencia nacional de anemia y sobrepeso u obesidad fue 1.8% (IC95%: 1.5-2.1). El incremento de la edad constituye un factor protector para la aparición de anemia sobrepeso y obesidad. El sexo femenino [OR: 0.62 (0.40 – 0.97); p=0.035] y el nivel de educación primaria completa de la madre [OR: 0.18 (0.03 – 0.98); p=0.047] fueron protectores para anemia y sobrepeso. Mientras que, el tercer orden de nacimiento [OR: 0.23 (0.07 – 0.76); p=0.016)] y el quintil superior de riqueza [OR: 0.04 (0.01 – 0.31); p=0.002] fueron factores protectores para anemia y obesidad. Conclusiones: Se describen una serie de factores protectores para anemia y sobrepeso o anemia y obesidad, como la edad, sexo, orden de nacimiento, quintil de riqueza y educación de la madre. Se necesitan más investigaciones que corroboren o complementen esta información.