Durante los últimos años el Perú viene combatiendo la desnutrición crónica infantil (DCI) exitosamente disminuyendo la cantidad de niños afectados en todo su territorio. Por su parte, la prevalencia de anemia infantil viene aumentando con el pasar de los años y es más evidente en poblaciones de altura. Ambas enfermedades son de gran importancia en salud pública debido a sus efectos sobre la salud infantil y posteriormente, su influencia en la productividad económica del país. Así también, se conoce que el uso del factor de corrección de la hemoglobina (hb) por la altura, aumenta la prevalencia de anemia en estas poblaciones y que esta es aún más alta en niños de 6 a 35 meses. El presente estudio tiene como objetivo determinar la relación entre la DCI y la anemia infantil (corregida y no corregida) en niños menores de 0 a 59 meses de edad en la región de Lima y Callao entre los años 2012 y 2017, analizando los datos reportados por el Sistema de Información del Estado Nutricional del Perú; y controlados por año, altitud, sexo y edad. Los resultados obtenidos en este estudio muestran que las prevalencias de DCI y anemia infantil varía para los diferentes grupos de edad y altitudes evaluadas al usar hb corregida y no corregida. De igual manera, la prevalencia de DCI y anemia infantil se ve aumentada en provincias con altura promedio mayor a 1000 m.s.n.m. Además, también se ve una variación al evaluar severidad de anemia (corregida y no corregida) en niños con DCI. Se concluye que sí existe una relación entre la DCI y la anemia infantil en niños menores de 60 meses que residen en la región departamental de Lima y Callao; incluso, al corregir hb por altura, y puede verse influenciada al evaluarse por edad y altitud de residencia.