Antecedentes: El tratamiento del conducto radicular es un procedimiento importante, en el cual se debe tener especial cuidado con la manipulación de la instrumentación para evitar complicaciones durante el procedimiento e impedir la presencia de dificultades tanto en la pieza dentaria como en el paciente y poder optimizar de esta manera el resultado final. Objetivo: Evaluar la frecuencia de las complicaciones en la preparación biomecánica de piezas molares durante el tratamiento endodóntico en pacientes atendidos por alumnos de pregrado en el Centro Dental Docente de la Facultad de Estomatología de la Universidad Peruana Cayetano Heredia. Metodología: El estudio es de tipo observacional, descriptivo y retrospectivo, se utilizaron piezas molares con tratamiento endodóntico que cumplían con los criterios de selección. Se revisaron las radiografías digitales siguientes: inicial, de conductometría, conometría y obturación final. Resultados: La mayor frecuencia se observó para la variable de pérdida de longitud con un 44.07% en piezas molares inferiores y un 31.23% en piezas molares superiores, por el contrario la fractura de instrumento presentó una menor frecuencia con un 0.59% en las piezas molares inferiores. El sexo femenino y el cuarto año de estudio fue lo más frecuente para todas las variables; asimismo la edad más predominante fue de 30 a 59 años. Conclusiones: Las complicaciones más frecuentes fueron: pérdida de longitud y perforación apical. Esto se podría deber a la falta de experiencia y seguridad de parte del estudiante en atender detalles durante el procedimiento así como limitaciones en el uso de localizadores apicales electrónicos.Background: Root canal treatment is an important procedure, in which special care must be taken with the manipulation of the instrumentation to avoid complications during the procedure and prevent the presence of difficulties both in the tooth and in the patient and to optimize in this way the end result. Objective: To evaluate the frequency of complications in the biomechanical preparation of molar pieces during endodontic treatment in patients attended by undergraduate students at the Teaching Dental Center of the Faculty of Stomatology of the Universidad Peruana Cayetano Heredia. Materials and Methods: The study is observational, descriptive and retrospective, molars with endodontic treatment were used that met the selection criteria. The following digital radiographs were reviewed: initial, conductometry, conometry and final obturation. Results: The loss of length variable was observed more frequently with 44.07% in lower molar pieces and 31.23% in upper molar pieces, on the contrary, instrument fracture presented the lowest percentage with 0.59% in lower molar pieces. The female sex and the fourth year of study was the most frequent for all the variables; likewise, the most prevalent age was between 30 and 59 years. Conclusions: The most frequent complications were: loss of length and apical perforation. This could be due to a lack of experience and security on the part of undergraduate students as well as a lack of theoretical-practical knowledge.