Algunas neoplasias como el cáncer cervical (CESC), de cabeza y cuello (HNSCC) e hígado (LIHC) son causados por virus oncogénicos. La transformación por infección viral conlleva a múltiples cambios celulares, incluido el reajuste metabólico, mediante modificaciones en el DNA y expresión de genes reguladores. El metabolismo se ajusta a necesidades energéticas de células transformadas, favoreciendo ciertas rutas de suministro de energía. Las enzimas glutaminasas 1 y 2 (GLS1 y GLS2), reguladoras del metabolismo de glutamina, aminoácido clave para el metabolismo energético, son afectadas por la transformación celular. Sin embargo, no se sabe si la afectación de su expresión varía con el tipo de infección viral y si influyen en el pronóstico de la enfermedad. En este estudio indagamos si la expresión génica y el estado de infección están asociados al pronóstico de la enfermedad, analizando genomas de tejidos cancerosos del proyecto The Cancer Genome Atlas (TCGA). Se comparó la expresión y el número de copias de GLS1/GLS2 de las cohortes CESC, HNSCC y LIHC de TCGA. Luego correlacionamos el perfil genómico con el fenotipo aplicando pruebas estadísticas como Chi cuadrado, ANOVA de una vía, T de Welch y Kaplan Meier. El número de copias de GLS1/2 no varió en los tumores de estudio. Sin embargo, comparadas con muestras normales, hubo sobreexpresión de GLS1 en pacientes con HNSCC y LIHC mientras que pacientes con LIHC mostraron subexpresión de GLS2. Así mismo, pacientes con CESC HPV+ y HNSCC HPV- tuvieron sobreexpresión de GLS1, comparadas con CESC HPV- y HNSCC HPV+. El gen GLS2 se sobreexpresó en individuos con HNSCC HPV+ (vs HNSCC HPV-). Finalmente, la expresión de GLS2 resultó ser un marcador pronóstico en CESC. Los resultados sugieren que la expresión de glutaminasas varía en función de la infección viral, en pacientes con cáncer, influyendo en la sobrevida global en CESC.