Antecedentes y objetivos: A una misma altitud, las personas con mayor hipoxemia tendrían mayores niveles de hemoglobina (Hb) que aquellos menos hipoxémicos. No se conoce si los mayores grados de hipoxemia (medidos por mayores niveles de Hb) afectan la glucemia basal y perfil lipídico a una altura 4.100 m (Carhuamayo y Junín). Materiales y métodos: Se evaluaron las concentraciones de glucosa, perfil lipídico, hemoglobina, y el índice de masa corporal (IMC) en 158 varones y 348 mujeres de 35 a 75 anos de edad. Se evaluó también la asociación entre las concentraciones de lípidos y de glucosa con la presión arterial sistólica y diastólica (PAD). Los resultados se analizaron con la prueba t de student, prueba del chi cuadrado, análisis de varianza, correlaciones y análisis multivariados lineales ajustados por edad, sexo, IMC, hábito de fumar y educación. Resultados: Los mayores niveles de hemoglobina estuvieron asociados directamente con mayores concentraciones de colesterol total (P < 0,001), colesterol de las lipoproteínas de baja densidad (P < 0,002), colesterol---no de las lipoproteínas de alta densidad (no-HDL) (P < 0,01) y triglicéridos (P < 0,01). No se observó asociación de hemoglobina con la glucemia (P > 0,05). Las concentraciones del colesterol total, colesterol de lipoproteínas de alta densidad, triglicéridos, y de lipoproteínas de muy baja densidad y glucemia estuvieron asociados directamente con la PAD. Conclusiones: En las habitantes de altura (4.100 m), la fracción de colesterol no-HDL y los triglicéridos se asocian directamente con el valor de hemoglobina, y los incrementos en estos se asocian a su vez con mayor PAD.