Candida albicans yeast remains the most frequently isolated in immunocompromised patients. The analysis of random amplified polymorphic DNA RAPD was used to develop genetic markers in different species and varieties and to discriminate between isolates of pathogenic yeasts. Objective: To determine the genetic variability among strains of Candida albicans isolated from clinical samples from cancer patients carriers of urinary catheter, hospitalized at the Institute of Neoplastic Diseases (INEN) in Lima, by RAPD technique. Material and Methods: The strains isolated from vaginal swabs and urine were characterized phenotypically and worked with three primers OPBA03, OPBA09 and OPBA10 for RAPD. Results: Of the 17 isolates, 15 were identified as C. albicans and C. glabrata and 2. The dendrogram grouped the 15 strains clusters, where two closely related cluster level clonality were observed. Conclusions: There is variability between strains of C. albicans isolated from clinical samples with primers used. (AU)Candida albicans sigue siendo la levadura aislada con mayor frecuencia en pacientes inmunodeprimidos. El análisis del ADN polimórfico amplificado al azar es usado para análisis de similitud entre cepas de una misma especie y asociar genotipos particulares a caracteres fenotípicos de los aislados. Objetivo: Conocer la variabilidad genética entre cepas de C. albicans aisladas de muestras clínicas de pacientes oncológicos portadores de catéter urinario, hospitalizados en el Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas (INEN) en Lima. Material y Métodos: En seis meses de vigilancia, se buscaron cepas de levaduras de muestras de orina e hisopado vaginal, caracterizándolas fenotipicamente según los métodos convencionales en micología médica y la susceptibilidad antifúngica por método de difusión en agar. El ADN extraído de las cepas de C. albicans se genotipificó por el método Random Amplified Polymorphic DNA o RAPD, usando tres partidores arbitrarios en forma independiente, generando dendrogramas de similitud para su análisis. Resultados: En el periodo estudiado de 60 pacientes se aislaron 17 cepas de Candida spp (28,3%), principalmente de orina (P<0,05). Se identifican 15 C. albicans y 2 C. glabrata, siendo todas susceptibles a Anfoterina B, itraconazol, fluconazol y voriconazol. El dendrograma evidenció variabilidad genética entre los aislados de C. albicans y registró dos ramas con índice de similitud (Sab) sobre 90% entre algunas cepas relacionas por tipo de muestra, fecha de colecta y servicio. Conclusiones: Existe variabilidad entre las cepas de C. albicans aisladas a partir de muestras clínicas de pacientes del INEN en Lima, Perú. (AU)