La finalidad del presente estudio fue determinar el efecto terapéutico de la aplicación del Gel Aloe vera en perros con periodontitis severa, comparando su efecto con el Gel de Clorhexidina, que es el tratamiento convencional. Se evaluaron 2 grupos de estudio con 10 animales cada uno, durante 6 semanas. Durante el tratamiento, se aplicó el Gel de Aloe vera a un grupo y Gel de Clorhexidina al otro en las bolsas periodontales, según correspondió, y se utilizó como control el inicio y final de cada tratamiento. Se midió la profundidad de la bolsa periodontal a las semanas 0, 2, 4 y 6, tomándose muestras para análisis bacteriano previo a cada tratamiento. En ambos grupos se observó una disminución significativa de la variable unidades formadoras de colonias/mm3, de la profundidad de las bolsa periodontales y del índice gingival, no encontrándose diferencias significativas entre los resultados de ambos tratamientos. Con ello se demostró que la aplicación del Gel de Clorhexidina y Aloe vera presentaron un efecto terapéutico similar para la reducción de los signos clínicos de la enfermedad periodontal.