La transmisión de la malaria en la Amazonía Peruana es causada principalmente por Plasmodium vivax y transmitida por Nyssorhynchus (previamente Anopheles) darlingi. La ecología larval de esta especie y su relación con la abundancia y distribución de adultos no esta bien establecida, por la tanto, el objetivo de este estudio es identificar y caracterizar los criaderos de Anofelinos y determinar su abundancia, diversidad e infección natural en comunidades a lo largo de dos cuencas hidrográficas en el distrito Mazan-Loreto. Para esto se realizó un estudio longitudinal durante el 2018 cubriendo la estación lluviosa y seca (2 muestreos por estación) en 3 comunidades del río Napo (API<10) y 3 del río Mazan (API>10). Mediante el uso de drones se identificaron los criaderos alrededor de las comunidades (radio 500m). Se realizaron capturas larvales y mediciones de factores biológicos, fisicoquímicos y ambientales para cada criadero detectado. Simultáneamente, las capturas de adulto se realizaron mediante cebo humano (18:00-06:00). En total, se realizaron 143 muestreos larvales (10 criaderos por comunidad). Los criaderos de la cuenca del Mazan tuvieron una mayor cobertura de dosel; y un pH y conductividad ás bajos que los criaderos de la cuenca del Napo. Se capturaron en total 18.110 anofelinos; la mayoría (69%) fueron capturados en peridomicilio. La especie predominante fue Ny. darlingi (92%) y por identificación molecular se identificaron Ny. konderi, Ny. oswaldoi s.l., Ny. rangeli y Ny. dunhami. La tasa de infección por Plasmodium fue de 0.0068 (109 con P. vivax y 15 con P. falciparum). La tasa de inoculación entomológica fue mayor en el Mazan (1.58) que en el Napo (0.14). Estos resultados preliminares sugieren que las diferentes dinámicas ambientales a lo largo de las cuencas crean variaciones en la disponibilidad, productividad y distribución de los criaderos, lo que podría explicar en parte por qué la transmisión persiste durante todo el año en Mazan pero no en el Napo.