El propósito de este estudio fue determinar la frecuencia de automedicación en pacientes que acuden al servicio de odontología en una institución pública y privada, pertenecientes al distrito de San Martin de Porres de la ciudad de Lima en el período del 2012 - 2013. Fue un estudio de tipo observacional, transversal y comparativo. La población estuvo conformada por todos los pacientes que se atienden en el servicio de Odontología de una institución pública (Hospital Cayetano Heredia) y una institución Privada (Clínica Estomatológica Dental de la UPCH) Lima - Perú. Se calculó el tamaño de muestra, por lo que se encuestó en el hospital 202 pacientes, y en clínica se encuestó 253 pacientes. Se realizó la encuesta a los pacientes que acudieron al servicio de odontología de ambas instituciones, los cuestionarios fueron entregados a los pacientes en las salas de espera de cada institución, previa firma del consentimiento informado. Los resultados muestran que se encontró un total de 202 pacientes que acudieron al "Hospital Nacional Cayetano Heredia", los cuales fueron pacientes mayores de 18 años, en donde el 18.32% de los pacientes dijeron que no se automedicaban y el 81.68% de los pacientes dijeron que si se automedicaban. En la institución privada se encontró un total de 253 pacientes que acudieron a la "Clínica dental Cayetano Heredia", los cuales fueron pacientes mayores de 18 años, en donde el 37.55% dijeron que no se automedicaban y el 62.45% de los pacientes dijeron que si se automedicaban.