Introduction. Giardiasis is caused by an intestinal protozoan, Giardia lamblia. Despite its high prevalence and geographical transmission variability, there is no risk stratification tool available to prioritize interventions. Objective. To estimate the prevalence of G. lamblia in Peruvian preschoolers and schoolchildren by ecoregion from 1990 to 2018. Methods. Based on a previous meta-analysis, we conducted a G. lamblia prevalence sub-analysis by ecoregions from data of 26 studies in Peruvian preschoolers and school-aged children between 1990 and 2018. The data was extracted by district, a classification by ecoregions was made through Google Earth. Heterogeneity was analyzed using Cochrane Q test and publication bias applying the Egger method with StatsDirect version 3.2.7. The absolute risk method was performed to stratify the prevalence at district level, and 4 strata were defined based on percentiles or arbitrarily. Results. Forty-three district-level prevalence data was estimated, including 7,606 participants. The highest pooled prevalences by the randomeffects method of G. lamblia were 47.0% (95% CI: 40.0-54.0) in the Pacific desert, 27.9% (95% CI: 22.8-33.2) in the lowland forest and 26.9% (95% CI 22.5-31.5) in the Puna. Conclusions. Of every 100 preschoolers and school-aged children living in the Pacific desert, lowland forest, and in the Puna ecoregions, 47, 28, and 27 minors are infected with G. lamblia, respectively. Likewise, 4 risk strata are proposed based on prevalence: sporadic (0 to <1%), hypoendemic (1 to <25%), mesoendemic (≥25 to <50%) and hyperendemic (≥50%).Introducción. La giardiasis es ocasionada por el protozoario intestinal Giardia lamblia, su transmisión tiene variabilidad geográfica y a pesar de ser muy frecuente, no existe una herramienta de estratificación de riesgo para priorizar las intervenciones. Objetivo. Estimar la prevalencia de G. Lamblia en preescolares y escolares peruanos por ecorregiones entre 1990 a 2018. Métodos. A partir de un metaanálisis previo, se realizó un subanálisis por ecorregiones de la prevalencia de G. lamblia en 26 estudios en preescolares y escolares peruanos entre 1990 a 2018. Se extrajeron los datos por distrito y utilizando Google Earth fueron clasificados en ecorregiones. La heterogeneidad fue analizada mediante la prueba de Q de Cochrane y el sesgo de publicación mediante el método de Egger con StatsDirect versión 3.2.7. Se utilizó el método de riesgo absoluto para estratificar la prevalencia a nivel de distrito y se definió 4 estratos en base a los percentiles o arbitrariamente. Resultados. Se identificaron 43 datos de prevalencia a nivel de distrito que incluyeron 7606 participantes. Las prevalencias combinadas más altas por el método de efectos aleatorios de G. lamblia fueron de 47,0% (intervalo de confianza (IC) 95%: 40,0 -54,0) en el desierto del Pacífico; 27,9% (IC95%: 22,8 - 33,2) en selva baja y 26,9% (IC95%: 22,5 - 31,5) en la Puna. Conclusiones. De cada 100 preescolares y escolares que viven en las ecorregiones del desierto del Pacífico, selva baja y Puna, 47, 28 y 27 menores de edad, respectivamente, están infectados con G. lamblia. Asimismo, se propone 4 estratos de riesgo en función de la prevalencia: esporádico (0 a <1%), hipoendémico (1 a <25%), mesoendémico (≥25 a <50%) e hiperendémico (≥50%).