Estudio exploratorio de la presencia de Escherichia coli productoras de β-lactamasas de espectro extendido aisladas de muestras clínicas de humanos, carne expendida en mercados y aves silvestres de la zona sur de Lima

Espinoza Ramirez, Kathya Cecilia

dc.contributor.advisor	Riveros Ramirez, Maribel Denise	es_ES
dc.contributor.advisor	Pons Casellas, Maria Jesus	es_ES
dc.contributor.advisor	Ruiz Blazquez, Joaquim	es_ES
dc.contributor.author	Espinoza Ramirez, Kathya Cecilia	es_ES
dc.date.accessioned	2024-02-23T16:10:52Z
dc.date.available	2024-02-23T16:10:52Z
dc.date.issued	2023
dc.identifier.other	203912	es_ES
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/20.500.12866/15049
dc.description.abstract	El presente estudio tuvo como objetivo determinar los niveles de resistencia a los antimicrobianos y clonalidad de Escherichia coli productoras de β-lactamasas de espectro extendido (BLEE) aisladas de tres diferentes orígenes: Clínica humana, carne expendida de mercado y aves silvestres de vida libre de la zona sur de Lima. Se recolectaron 125 muestras (63 muestras clínicas humanas, 21 muestras de carne de mercados y 41 muestras de hisopado cloacal y heces frescas de aves silvestres de vida libre). Se aisló e identifico fenotípicamente un total de 138 E. coli que provenían de muestras clínicas humanas (n= 48, 38.4%), carne de mercado (n=66, 52.8%) y aves de vida libre (n=24, 19.2%). Entre estos la presencia total de E. coli productoras de BLEE fue de 74 cepas con 70.8% (34/48) en aislados clínicos, 54.6% (36/66) en carnes de mercado y 16.7% (4/24) en aves silvestres de vida libre. Los niveles de resistencia para E. coli productoras de BLEE aislados de muestras clínicas humanas fue 88.2% (30/34) para ácido nalidíxico, ciprofloxacino y levofloxacino, 79.4% (27/34) cotrimoxazol, 55.9% (19/34) tobramicina y 14.7% (5/34) colistina. En carne de mercado, el 97% (35/36) para tetraciclinas, 94% (34/36) para ácido nalidíxico, ciprofloxacino y levofloxacino, 86% (31/36) cotrimoxazol, 78% (28/36) tobramicina y 47% (17/36) colistina. En aves silvestres, solo las muestras de heces frescas de Gallinazo Cabeza negra (Coragyps atratus) y Cormorán Neotropical (Phalacrocorax brasilianus) presentaron resistencia al 100% (4/4) ácido nalidíxico, ciprofloxacino y levofloxacino, 50% (2/4) gentamicina, 100% (4/4) para tobramicina, tetraciclina y cotrimoxazol. Se observó un patrón de Multirresistencia (MDR) en los diferentes tipos de muestras. Entre los aislados de E. coli BLEE se reportó con mayor frecuencia la variante CTX-M-55 para los tres orígenes. En humanos y carnes de mercado se detectó la variante CTX-M-15, y, finalmente solo en humanos se detectó la variante CTX-M-27. Además, se detectaron las variantes CTX-M-65 y SHV-27 solo en carne de pollo. No se observó relación clonal entre las E. coli productoras de BLEE del estudio, mostrando una elevada diversidad clonal de los aislados.	es_ES
dc.description.abstract	The aim of this study was to identify, determinate the levels of antimicrobial resistance and clonality of extended-spectrum β- lactamase (ESBL) in E. coli from three different origins: Human clinic, Market meat and free-living wild birds in the south of Lima. A total of 125 samples were collected, corresponding to 63 humans clinical, 21 market meat and 41 of cloacal swabs and fresh feces from free-living wildbirds. Subsequently, a total of 138 E. coli was isolated and phenotypically identified from human clinical (n=48) market meat (n=66) and free-living wild birds (n=24). Among, the presence of ESBL-producing E. coli was 74 strains with 70.8% (34/48) in clinical isolates, 54.6% (36/66) in market meat and 16.7% (4/24) in wild birds. The resistance levels for ESBL producing E. coli from clinical isolated was 88.2% (30/34) for nalidixic acid, ciprofloxacin and levofloxacin, 79.4% (27/34) for cotrimoxazole, 55.9% (19/34) for tobramycin, 14.7% (5/34) for colistin. In market meat samples was 97% (35/36) presented resistance to tetracyclines, 94% (34/36) to nalidixic acid, ciprofloxacin and levofloxacin, 86% (31/36) cotrimoxazole, 78% (28/36) tobramycin and 47% (17/36) for colistin. Finally, in wild birds only the samples of fresh feces of Black Vulture (Coragyps atratus) and Neotropical Cormorant (Phalacrocorax brasilianus) presented resistance to 100% (4/4) nalidixic acid, ciprofloxacin and levofloxacin, 50% (2/4) gentamicin, 100% (4/4) tobramycin, tetracycline and cotrimoxazole. A Multidrug Resistance (MDR) pattern was observed in the different types of samples. Among the ESBL-producing E. coli isolates, the CTX-M-55 variant was reported most frequently reported for the three origins. In humans and market meat, the CTX-M-15 variant was detected, while the CTX-M 27 variant was detected only in humans. In addition, the CTX-M-65 and SHV-27 variants, were detected in chicken meat. No clonal relationship was observed between the ESBL- producing E. coli in the study, showing high clonal diversity of the isolates.	es_ES
dc.format	application/pdf	es_ES
dc.language.iso	spa	es_ES
dc.publisher	Universidad Peruana Cayetano Heredia	es_ES
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess	es_ES
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es	es_ES
dc.subject	E. coli	es_ES
dc.subject	Resistencia Antibiótica	es_ES
dc.subject	β-lactamasa de Espectro Extendido	es_ES
dc.subject	blaCTX-M	es_ES
dc.subject	Una Salud	es_ES
dc.title	Estudio exploratorio de la presencia de Escherichia coli productoras de β-lactamasas de espectro extendido aisladas de muestras clínicas de humanos, carne expendida en mercados y aves silvestres de la zona sur de Lima	es_ES
dc.type	info:eu-repo/semantics/masterThesis	es_ES
thesis.degree.name	Maestra en Microbiología	es_ES
thesis.degree.grantor	Universidad Peruana Cayetano Heredia. Escuela de Posgrado Víctor Alzamora Castro	es_ES
thesis.degree.discipline	Microbiología	es_ES
dc.publisher.country	PE	es_ES
dc.subject.ocde	http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.01	es_ES
dc.subject.ocde	http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07	es_ES
dc.subject.ocde	http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.01.05	es_ES
renati.author.dni	47132371
renati.advisor.orcid	https://orcid.org/0000-0002-5347-3261	es_ES
renati.advisor.orcid	https://orcid.org/0000-0001-8384-2315	es_ES
renati.advisor.orcid	https://orcid.org/0000-0002-4431-2036	es_ES
renati.advisor.dni	41568960
renati.advisor.cext	001817203
renati.advisor.cext	004086240
renati.type	http://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis	es_ES
renati.level	http://purl.org/pe-repo/renati/nivel#maestro	es_ES
renati.discipline	511247	es_ES
renati.juror	Sheen Cortavarria, Patricia	es_ES
renati.juror	Bauer Cuya, Jose Luis	es_ES
renati.juror	Hurtado Custodio de Berastain, Jasmín Elena	es_ES