La resistencia antibiótica constituye un serio problema de salud pública ya que aumenta la morbilidad y mortalidad de humanos y animales. En los últimos años se ha observado un incremento alarmante de la resistencia al florfenicol (antibiótico de uso veterinario exclusivo) como consecuencia de su uso intensivo en el sector agropecuario. FloR es el gen de resistencia más comúnmente reportado, y ha sido detectado en patógenos que colonizan personas, incluyendo niños. Este estudio tuvo como objetivo determinar la incidencia y los factores asociados a la aparición del gen floR en niños de cero a dos años. Se trabajó con los datos de un cuestionario y con muestras de heces de 198 niños que participaron en un estudio de cohortes titulado “La infección natural de norovirus y sapovirus en una cohorte de nacimiento en una comunidad periurbana del Perú”. La presencia del gen floR en las muestras analizadas se determinó mediante PCR-CRISPR- Cas12a. La incidencia acumulada fue de 0,5 casos positivos/100 niños-meses y se estableció que el 89% de los niños adquirió el gen en algún momento del periodo de monitoreo. Se realizó una regresión de Cox que demostró que la disposición de aguas residuales en campo abierto es un factor de riesgo para la adquisición del gen (p=0,023), mientras que la presencia de pollos en el hogar no fue significativa (p=0,122).Antibiotic resistance poses a serious public health problem as it increases morbidity and mortality in humans and animals. In recent years, an alarming rise in resistance to florfenicol (an antibiotic for veterinary use only) has been observed as a consequence of its intensive use in the agricultural sector. FloR is the most commonly reported resistance gene, and has been detected in pathogens that colonize people, including children. The aim of this study was to determine the incidence and factors associated with the appearance of the floR gene in children aged from zero to two years. We worked with questionnaire data and stool samples from 198 children who participated in a cohort study entitled “Natural norovirus and sapovirus infection in a birth cohort in a peri-urban community in Peru”. The presence of the floR gene in the analyzed samples was determined by the PCR-CRISPR-Cas12a system. The cumulative incidence was 0,5 positive cases/100 child-months and it was established that 89% of the children acquired the gene at some time during the monitoring period. Cox regression was used, demonstrating that open field sewage disposal is a risk factor for gene acquisition (p=0,023), while the presence of chickens at home was not significant (p=0,122).