Caracterización genómica de aislados clínicos de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina en Latinoamérica, 2000 - 2024

Guanilo Castro, Tahnee Elaine; Saldaña Valentin, Lesly Alely

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Tecnología Médica en la Especialidad de Laboratorio Clínico y Anatomía Patológica
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dc.contributor.advisor	Cuicapuza Arteaga, Diego Bernhard	es_ES
dc.contributor.author	Guanilo Castro, Tahnee Elaine	es_ES
dc.contributor.author	Saldaña Valentin, Lesly Alely	es_ES
dc.date.accessioned	2025-02-14T14:48:01Z
dc.date.available	2025-02-14T14:48:01Z
dc.date.issued	2024
dc.identifier.other	214523	es_ES
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/20.500.12866/16727
dc.description.abstract	Antecedentes: Staphylococcus aureus resistente a meticilina (MRSA) contiene el gen mecA en el elemento genético móvil SCCmec, que le confiere resistencia a antibióticos β-lactámicos. En Latinoamérica, el clon USA300 (CC8-SCCmecIVa-t008) está siendo reemplazado por el clon Río de Janeiro “Rdj” (CC5-ST105-IIa-t002), lo que representa una amenaza debido a la versatilidad de sus factores de virulencia. Este fenómeno requiere un análisis detallado para comprender su impacto y evolución en la región. Objetivo: Caracterizar genómicamente las secuencias públicas de MRSA en Latinoamérica en el periodo del 2000-2024. Material y métodos: Se realizó un estudio observacional transversal utilizando 994 secuencias MRSA de 13 países latinoamericanos, obtenidas de la base de datos del NCBI. Los genomas en formato FASTA fueron sometidos a un análisis bioinformático que incluyó de un control de calidad, identificación SCCmec, secuenciotipos (STs), factores de virulencia, genes y mutaciones asociadas a resistencia. Además, se realizó un análisis filogenético para determinar la agrupación de filogrupos. Resultados: El genotipo CC5-SCCmecIIa-ST105-t002-lukD/E-PV+ predominó en un 18% en países como Brasil y Chile, seguido de CC30-SCCmec-IVc-t019-lukF/S-PV+ con 8.6% en Argentina. El 75% de los genomas presentaron el elemento genético COMER y más del 90% contenían genes codificadores de la toxina PVL. Conclusiones: Nuestro estudio reveló el predominio del clon CC5-ST105-IIa-t002 (Rdj) en países de Latinoamérica, con un 21.3%.	es_ES
dc.description.abstract	Background: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) possesses the mecA gene in the SCCmec mobile genetic element, which confers resistance to various β-lactam antibiotics. In Latin America, the USA300 clone (CC8-SCCmecIVa-t008) is being replaced by the Rio de Janeiro “Rdj” clone (CC5-ST105-IIa-t002), which represents a threat due to the versatility of its virulence factors. However, this phenomenon requires a rigorous and detailed analysis to better understand its impact and evolution in the region Objectives: To genomically characterize the public MRSA sequences in Latin America in the period 2000-2024 Methods: A cross-sectional observational study was carried out. 994 MRSA sequences from 13 Latin American countries were selected from the NCBI public database. The genomes in FASTA format were subjected to quality control, bioinformatic analysis to identify SCCmec, sequence type (STs), virulence factors, genes and mutations associated with resistance. Additionally, a phylogenetic analysis was performed to determine the grouping of phylogroups. Results: The CC5-SCCmecIIa-ST105-t002-lukD/E-PV+ genotype predominated by 18% in countries such as Brazil and Chile, followed by CC30-SCCmec-IVc-t019-lukF/S-PV+ with 8.6% in Argentina. It was found that 75% of the genomes presented the genetic element EAT. Conclusions: Our study revealed the predominance of the CC5-ST105-IIa-t002 clone in Latin American countries to date.	es_ES
dc.format	application/pdf	es_ES
dc.language.iso	spa	es_ES
dc.publisher	Universidad Peruana Cayetano Heredia	es_ES
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess	es_ES
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es	es_ES
dc.subject	Staphylococcus aureus Resistentes a Meticilina (MRSA)	es_ES
dc.subject	Epidemiología Molecular	es_ES
dc.subject	Secuenciación del Genoma Completo	es_ES
dc.subject	Cassette	es_ES
dc.title	Caracterización genómica de aislados clínicos de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina en Latinoamérica, 2000 - 2024	es_ES
dc.title.alternative	Genomic characterization of clinical isolates of methicillin-resistant Staphylococcus aureus in Latin America, 2000 - 2024	es_ES
dc.type	info:eu-repo/semantics/bachelorThesis	es_ES
thesis.degree.name	Licenciado en Tecnología Médica en la Especialidad de Laboratorio Clínico y Anatomía Patológica	es_ES
thesis.degree.grantor	Universidad Peruana Cayetano Heredia. Facultad de Medicina Alberto Hurtado	es_ES
thesis.degree.discipline	Tecnología Médica en la Especialidad de Laboratorio Clínico y Anatomía Patológica	es_ES
dc.publisher.country	PE	es_ES
dc.subject.ocde	http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.01	es_ES
dc.subject.ocde	http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07	es_ES
dc.subject.ocde	http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.01.05	es_ES
dc.subject.ocde	http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.09	es_ES
renati.author.dni	70335853
renati.author.dni	72682223
renati.advisor.orcid	https://orcid.org/0000-0002-5735-4614	es_ES
renati.advisor.dni	75272535
renati.type	https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis	es_ES
renati.level	https://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesional	es_ES
renati.discipline	915126	es_ES
renati.juror	Neyra Valdez, Lidio Edgar	es_ES
renati.juror	Quispe Manco, Maria del Carmen	es_ES
renati.juror	Figueroa Tataje, Jaime Jose	es_ES