Introducción: El dengue constituye un importante problema de salud pública a nivel mundial, afectando a más de 120 países y generando aproximadamente 100 millones de infecciones anuales, con cerca de 500,000 hospitalizaciones por año. En el año 2018, la región de Cusco, Perú, registró una tasa de notificación de 1,9 casos por cada 10,000 habitantes.Metodología: Se realizó un estudio transversal utilizando registros del sistema de vigilancia epidemiológica entre los años 2018 y 2021, con el objetivo de identificar factores asociados a casos de dengue con complicaciones. Se incluyeron registros del sistema de vigilancia epidemiológica considerando variables como sexo, edad, presencia de comorbilidades, tipo de episodio (primoinfección o reinfección) y el período temporal (pre-pandemia vs. pandemia). Las complicaciones se definieron como signos de alarma, hospitalización o fallecimiento dentro de los 30 días del diagnóstico. Se aplicó un modelo de regresión de Poisson multivariado para estimar razones de prevalencia ajustadas. Resultados: Se analizaron 1,729 casos confirmados de dengue, de los cuales el 3,18% (n=55) presentó complicaciones. Se identificó una mayor prevalencia de complicaciones en los grupos de 0–11 años (PR=4,35; IC95%: 1,46–12,92), 30–59 años (PR=2,93; IC95%: 1,22–6,99) y ≥60 años (PR=2,92; IC95%: 0,91–9,31). La presencia de comorbilidades también se asoció a una mayor prevalencia de casos de dengue con complicaciones (PR=2,59; IC95%: 1,20–5,61). Por el contrario, el periodo pandémico mostró una menor prevalencia de complicaciones (PR=0,31; IC95%: 0,17–0,55). Conclusiones: Los casos de dengue con complicaciones en la región de Cusco estuvieron asociados a la edad (menores de 12 años, adultos entre 30 y 59 años, y adultos mayores) y a la presencia de comorbilidades. Además, se evidenció una menor proporción de complicaciones durante el periodo pandémico, posiblemente relacionada con los cambios en la dinámica sanitaria regional durante la pandemia por COVID-19.Introduction: Dengue represents a significant global public health concern, affecting more than 120 countries and causing approximately 100 million infections annually, with nearly 500,000 hospitalizations each year. In 2018, in Cusco, Peru it was reported with a rate of 1.9 cases per 10,000 inhabitants.Methodology: A cross-sectional study was conducted to identify factors associated with dengue-related complications in Cusco, Peru during 2018–2021. All records from the dengue epidemiological surveillance system were included, considering variables such as sex, age, presence of comorbidities, type of infection (primary or secondary), and time period (pre-pandemic vs. pandemic). Dengue complications were defined as the presence of warning signs, hospitalization, or death occurring within 30 days of diagnosis. A multivariate Poisson regression model was applied to estimate adjusted prevalence ratios.Results: A total of 1,729 confirmed dengue cases were analyzed, of which 3.18% (n=55) presented with complications. Multivariable model showed a higher prevalence of dengue-related complications in the age groups 0–11 years (PR=4.35; 95%CI: 1.46–12.92), 30–59 years (PR=2.93; 95%CI: 1.22–6.99), and ≥60 years (PR=2.92; 95%CI: 0.91–9.31). The presence of comorbidities was also associated with an increased prevalence of dengue complications (PR=2.59; 95%CI: 1.20–5.61). Conversely, the pandemic period showed a lower prevalence of complications (PR=0.31; 95%CI: 0.17–0.55).Conclusions: Dengue-related complications in Cusco, Peru were associated with age (<12 years, 30–59 years, and >60 years) and the presence of comorbidities. Additionally, a lower proportion of complications was observed during the pandemic period, potentially related to changes in regional healthcare dynamics during the COVID-19 pandemic.