En el Hospital Nacional Docente Madre Niño San Bartolomé de Lima revisamos y valoramos 72.644 frotis cervicales con el objetivo de determinar la calidad de la muestra coloreada con Papanicolaou. Se diseñó una perspectiva analítica-correlacional y un estudio transversal con las muestras obtenidas de 5 distritos del sistema de salud. El procesamiento citológico era acorde con los requerimientos internacionales para la citopatología. La interpretación citológica se llevó a cabo según el sistema Bethesda. De los 72.644 frotis cervicales valorados con el sistema de calidad de Bethesda, el 3,6 % (2.615 muestras) no eran aptas por ser la muestra inadecuada (MI), debido en gran parte a la presencia de >75% de leucocitos (49 %), poca celularidad (24 %) e insuficiente fijación (20 %). El índice de Youden era de 0,7 para MI con una variación significante del negativo para las lesiones intraepiteliales o malignidad (p = 0,71). Los distritos de salud Rímac, Túpac Amaru, Lima y Puente Piedra aportaron 849 (33 %), 723 (28 %), 675 (25 %) y 365 (14 %) de MI, respectivamente. Se encontró una correlación directa estadísticamente significativa entre el lugar de origen de las muestras y el número de MI (p < 0,005; rho = 0,492). El número de frotis con MI o con mala calidad sobrepasa los límites establecidos por varios organismos internacionales. La proporción de hallazgos no neoplásicos fue considerable y las anomalías epiteliales, escamosas y glandulares estuvieron dentro de la media nacional. Para desarrollar un estudio citológico adecuado se requieren métodos de evaluación de calidad en todas las fases del cribado y de esta forma cumplir con los requisitos internacionales de calidad, adecuarse a la acreditación y conseguir una mejoría continua.