En la actualidad, el uso inadecuado de los antibióticos ha favorecido el incremento de la resistencia antimicrobiana de Aeromonas salmonicida, microorganismo que frecuentemente afecta el cultivo de la trucha arcoíris. En el presente estudio se ha identificado bioquímica y molecularmente A. salmonicida, aisladas de truchas arcoíris (Oncorhynchus mykiss) procedentes de cuatro Regiones de la Sierra del Perú. A continuación, se determinó el perfil de susceptibilidad antibiótica e identificó por PCR los genes de resistencia antimicrobiana. De los 28 aislados obtenidos, algunos mostraron baja susceptibilidad (tipo no salvaje - NWT) frente a amoxicilina (96%), oxitetraciclina (64%), ácido oxolínico (57%), destacándose el perfil no salvaje amoxicilina- ácido oxolínico- oxitetraciclina (43%), indicativo de multidrogo-resistencia (MDR). Los genes sul1 y tetA fueron identificados en el 6.6% (2/30) y 3.3% (1/30) de los aislados, respectivamente. Además, el secuenciamiento del gen gyrA, permitió confirmar la presencia de mutaciones en los codones 83 y 92 de la Región Determinante de Resistencia a Quinolonas (QRDR), sugiriendo su participación en los fenotipos no salvajes identificados frente a este antimicrobiano. Los resultados muestran que los aislados de A. salmonicida obtenidos presentan perfiles de resistencia comparables a los de otros países lo cual debe afectar el éxito terapéutico frente a este patógeno.