Los parásitos más comunes de la tilapia son los monogeneos, se encuentran principalmente en las branquias, provocando irritación e hiperplasia de las lamelas, hipersecreción de mucus, hipertrofia y fusión de los filamentos, lo cual dificulta la respiración de los peces, ocasionando problemas en el cultivo. En el Perú, no se ha identificado los monogeneos causantes de estos problemas en el cultivo de tilapia, por este motivo se hizo necesario identificar las especies que la parasitan, con la finalidad de conocer estos agentes infecciosos que perjudican la salud de estos peces, describir las lesiones histológicas y con ayuda de la microscopia electrónica de barrido (MEB) y observar detalles ultraestructurales de los órganos de fijación. Fueron colectados y analizados 40 tilapias Oreochromis niloticus (25,1± 18,4 g de peso y 10,2 ± 2.87 cm) en 4 centros de cultivos de la provincia de San Martín. De los 40 peces examinados, 37 estaban parasitados con un total de 1584 monogeneos, prevalencia (P%) del 92.5%, intensidad media (IM) de 42.9 parásitos/pez y abundancia media (AM) de 39.6 parásitos/pez. Se identificaron tres especies de monogeneos: Cichlidogyrus sclerosus, Cichlidogyrus thurstonae y Cichlidogyrus sp. En las branquias, y una especie de monogeneo: Gyrodactilus sp. en la piel y aletas. El análisis histopatológico mostró como lesiones principales: Infiltrado eosinofílico y infiltrado linfocitario, hiperplasia, desprendimiento del epitelio, edema y fusión. La microscopia electrónica de barrido MEB permitió observar con detalles las ancoras de los monogeneos, con los que se fijan a las branquias causando lesiones.